Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYS6

Uncharacterized protein C2orf72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CYS6 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9CYS6 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9CYS6 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9CYS6 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9CYS6 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9CYS6 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9CYS6 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Q9CYS6 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Q9CYS6 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9CYS6 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9CYS6 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9CYS6 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9CYS6 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9CYS6 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9CYS6 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9CYS6 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9CYS6 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9CYS6 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9CYS6 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9CYS6 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9CYS6 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9CYS6 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9CYS6 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9CYS6 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9CYS6 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9CYS6 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9CYS6 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9CYS6 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9CYS6 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9CYS6 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9CYS6 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9CYS6 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9CYS6 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9CYS6 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9CYS6 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9CYS6 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9CYS6 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9CYS6 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9CYS6 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9CYS6 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9CYS6 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9CYS6 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9CYS6 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9CYS6 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9CYS6 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9CYS6 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9CYS6 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9CYS6 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9CYS6 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9CYS6 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9CYS6 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9CYS6 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9CYS6 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9CYS6 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9CYS6 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9CYS6 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9CYS6 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9CYS6 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9CYS6 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9CYS6 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9CYS6 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9CYS6 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9CYS6 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9CYS6 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9CYS6 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9CYS6 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CYS6 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CYS6 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CYS6 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CYS6 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CYS6 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CYS6 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CYS6 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CYS6 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CYS6 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CYS6 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CYS6 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CYS6 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CYS6 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CYS6 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CYS6 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CYS6 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CYS6 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CYS6 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CYS6 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CYS6 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CYS6 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CYS6 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CYS6 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CYS6 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CYS6 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CYS6 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9CYS6 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9CYS6 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9CYS6 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9CYS6 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9CYS6 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9CYS6 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9CYS6 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9CYS6 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms