Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXK8

Nip7, 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nip7Q9CXK8 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Nip7Q9CXK8 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nip7Q9CXK8 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nip7Q9CXK8 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nip7Q9CXK8 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nip7Q9CXK8 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nip7Q9CXK8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nip7Q9CXK8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nip7Q9CXK8 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Nip7Q9CXK8 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nip7Q9CXK8 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nip7Q9CXK8 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Nip7Q9CXK8 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nip7Q9CXK8 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Nip7Q9CXK8 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nip7Q9CXK8 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nip7Q9CXK8 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nip7Q9CXK8 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nip7Q9CXK8 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nip7Q9CXK8 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nip7Q9CXK8 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nip7Q9CXK8 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nip7Q9CXK8 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nip7Q9CXK8 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nip7Q9CXK8 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nip7Q9CXK8 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nip7Q9CXK8 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nip7Q9CXK8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nip7Q9CXK8 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Nip7Q9CXK8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nip7Q9CXK8 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nip7Q9CXK8 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nip7Q9CXK8 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nip7Q9CXK8 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nip7Q9CXK8 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nip7Q9CXK8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nip7Q9CXK8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nip7Q9CXK8 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nip7Q9CXK8 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Nip7Q9CXK8 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nip7Q9CXK8 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nip7Q9CXK8 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Nip7Q9CXK8 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Nip7Q9CXK8 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nip7Q9CXK8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nip7Q9CXK8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nip7Q9CXK8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nip7Q9CXK8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nip7Q9CXK8 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nip7Q9CXK8 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nip7Q9CXK8 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nip7Q9CXK8 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nip7Q9CXK8 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nip7Q9CXK8 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nip7Q9CXK8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nip7Q9CXK8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nip7Q9CXK8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nip7Q9CXK8 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nip7Q9CXK8 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nip7Q9CXK8 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Nip7Q9CXK8 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Nip7Q9CXK8 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nip7Q9CXK8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nip7Q9CXK8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nip7Q9CXK8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nip7Q9CXK8 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nip7Q9CXK8 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nip7Q9CXK8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nip7Q9CXK8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nip7Q9CXK8 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nip7Q9CXK8 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Nip7Q9CXK8 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nip7Q9CXK8 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nip7Q9CXK8 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nip7Q9CXK8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nip7Q9CXK8 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nip7Q9CXK8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nip7Q9CXK8 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nip7Q9CXK8 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nip7Q9CXK8 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nip7Q9CXK8 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nip7Q9CXK8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nip7Q9CXK8 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Nip7Q9CXK8 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nip7Q9CXK8 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nip7Q9CXK8 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Nip7Q9CXK8 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nip7Q9CXK8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nip7Q9CXK8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nip7Q9CXK8 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nip7Q9CXK8 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nip7Q9CXK8 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nip7Q9CXK8 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nip7Q9CXK8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nip7Q9CXK8 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nip7Q9CXK8 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nip7Q9CXK8 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nip7Q9CXK8 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nip7Q9CXK8 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nip7Q9CXK8 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms