Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXD9

Lrrc17, Leucine-rich repeat-containing protein 17, mousemouse

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Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc17Q9CXD9 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
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Lrrc17Q9CXD9 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lrrc17Q9CXD9 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lrrc17Q9CXD9 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Lrrc17Q9CXD9 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lrrc17Q9CXD9 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lrrc17Q9CXD9 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lrrc17Q9CXD9 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lrrc17Q9CXD9 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lrrc17Q9CXD9 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lrrc17Q9CXD9 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lrrc17Q9CXD9 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lrrc17Q9CXD9 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lrrc17Q9CXD9 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lrrc17Q9CXD9 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
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Lrrc17Q9CXD9 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lrrc17Q9CXD9 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lrrc17Q9CXD9 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lrrc17Q9CXD9 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
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Lrrc17Q9CXD9 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lrrc17Q9CXD9 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
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Lrrc17Q9CXD9 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lrrc17Q9CXD9 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lrrc17Q9CXD9 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
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Lrrc17Q9CXD9 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
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Lrrc17Q9CXD9 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lrrc17Q9CXD9 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lrrc17Q9CXD9 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lrrc17Q9CXD9 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lrrc17Q9CXD9 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
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Lrrc17Q9CXD9 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
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Lrrc17Q9CXD9 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lrrc17Q9CXD9 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
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Lrrc17Q9CXD9 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
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Lrrc17Q9CXD9 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
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Lrrc17Q9CXD9 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrrc17Q9CXD9 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
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Lrrc17Q9CXD9 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
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Lrrc17Q9CXD9 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrrc17Q9CXD9 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrrc17Q9CXD9 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrrc17Q9CXD9 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrrc17Q9CXD9 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrrc17Q9CXD9 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrrc17Q9CXD9 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrrc17Q9CXD9 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrrc17Q9CXD9 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrrc17Q9CXD9 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrrc17Q9CXD9 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrrc17Q9CXD9 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrrc17Q9CXD9 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrrc17Q9CXD9 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrrc17Q9CXD9 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrrc17Q9CXD9 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrrc17Q9CXD9 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrrc17Q9CXD9 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrrc17Q9CXD9 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrrc17Q9CXD9 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
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