Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWN7

Cnot11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, mousemouse

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Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot11Q9CWN7 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnot11Q9CWN7 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnot11Q9CWN7 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnot11Q9CWN7 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnot11Q9CWN7 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnot11Q9CWN7 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnot11Q9CWN7 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnot11Q9CWN7 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnot11Q9CWN7 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnot11Q9CWN7 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnot11Q9CWN7 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnot11Q9CWN7 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnot11Q9CWN7 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnot11Q9CWN7 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnot11Q9CWN7 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnot11Q9CWN7 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnot11Q9CWN7 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnot11Q9CWN7 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnot11Q9CWN7 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnot11Q9CWN7 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnot11Q9CWN7 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnot11Q9CWN7 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnot11Q9CWN7 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnot11Q9CWN7 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnot11Q9CWN7 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnot11Q9CWN7 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnot11Q9CWN7 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnot11Q9CWN7 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnot11Q9CWN7 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cnot11Q9CWN7 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cnot11Q9CWN7 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cnot11Q9CWN7 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnot11Q9CWN7 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnot11Q9CWN7 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnot11Q9CWN7 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnot11Q9CWN7 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnot11Q9CWN7 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnot11Q9CWN7 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnot11Q9CWN7 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnot11Q9CWN7 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnot11Q9CWN7 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnot11Q9CWN7 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnot11Q9CWN7 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnot11Q9CWN7 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnot11Q9CWN7 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnot11Q9CWN7 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnot11Q9CWN7 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnot11Q9CWN7 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnot11Q9CWN7 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnot11Q9CWN7 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnot11Q9CWN7 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnot11Q9CWN7 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnot11Q9CWN7 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnot11Q9CWN7 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnot11Q9CWN7 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnot11Q9CWN7 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnot11Q9CWN7 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnot11Q9CWN7 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnot11Q9CWN7 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnot11Q9CWN7 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnot11Q9CWN7 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnot11Q9CWN7 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnot11Q9CWN7 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnot11Q9CWN7 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnot11Q9CWN7 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnot11Q9CWN7 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnot11Q9CWN7 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnot11Q9CWN7 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnot11Q9CWN7 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnot11Q9CWN7 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnot11Q9CWN7 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnot11Q9CWN7 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnot11Q9CWN7 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnot11Q9CWN7 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnot11Q9CWN7 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnot11Q9CWN7 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnot11Q9CWN7 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnot11Q9CWN7 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnot11Q9CWN7 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnot11Q9CWN7 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnot11Q9CWN7 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnot11Q9CWN7 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnot11Q9CWN7 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnot11Q9CWN7 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnot11Q9CWN7 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnot11Q9CWN7 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnot11Q9CWN7 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnot11Q9CWN7 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnot11Q9CWN7 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnot11Q9CWN7 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnot11Q9CWN7 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnot11Q9CWN7 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnot11Q9CWN7 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnot11Q9CWN7 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnot11Q9CWN7 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnot11Q9CWN7 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnot11Q9CWN7 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnot11Q9CWN7 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnot11Q9CWN7 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnot11Q9CWN7 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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