Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rhobtb3Q9CTN4 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Rhobtb3Q9CTN4 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Rhobtb3Q9CTN4 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rhobtb3Q9CTN4 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rhobtb3Q9CTN4 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Rhobtb3Q9CTN4 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rhobtb3Q9CTN4 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rhobtb3Q9CTN4 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rhobtb3Q9CTN4 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rhobtb3Q9CTN4 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rhobtb3Q9CTN4 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rhobtb3Q9CTN4 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rhobtb3Q9CTN4 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rhobtb3Q9CTN4 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Rhobtb3Q9CTN4 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Rhobtb3Q9CTN4 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rhobtb3Q9CTN4 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rhobtb3Q9CTN4 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rhobtb3Q9CTN4 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rhobtb3Q9CTN4 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rhobtb3Q9CTN4 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rhobtb3Q9CTN4 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rhobtb3Q9CTN4 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rhobtb3Q9CTN4 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rhobtb3Q9CTN4 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Rhobtb3Q9CTN4 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rhobtb3Q9CTN4 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rhobtb3Q9CTN4 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rhobtb3Q9CTN4 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rhobtb3Q9CTN4 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rhobtb3Q9CTN4 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rhobtb3Q9CTN4 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rhobtb3Q9CTN4 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rhobtb3Q9CTN4 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rhobtb3Q9CTN4 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rhobtb3Q9CTN4 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rhobtb3Q9CTN4 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rhobtb3Q9CTN4 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rhobtb3Q9CTN4 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rhobtb3Q9CTN4 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rhobtb3Q9CTN4 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rhobtb3Q9CTN4 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Rhobtb3Q9CTN4 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rhobtb3Q9CTN4 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rhobtb3Q9CTN4 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rhobtb3Q9CTN4 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rhobtb3Q9CTN4 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rhobtb3Q9CTN4 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rhobtb3Q9CTN4 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rhobtb3Q9CTN4 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rhobtb3Q9CTN4 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rhobtb3Q9CTN4 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rhobtb3Q9CTN4 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rhobtb3Q9CTN4 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rhobtb3Q9CTN4 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rhobtb3Q9CTN4 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rhobtb3Q9CTN4 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rhobtb3Q9CTN4 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rhobtb3Q9CTN4 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rhobtb3Q9CTN4 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rhobtb3Q9CTN4 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rhobtb3Q9CTN4 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rhobtb3Q9CTN4 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rhobtb3Q9CTN4 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rhobtb3Q9CTN4 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rhobtb3Q9CTN4 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rhobtb3Q9CTN4 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rhobtb3Q9CTN4 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rhobtb3Q9CTN4 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rhobtb3Q9CTN4 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rhobtb3Q9CTN4 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rhobtb3Q9CTN4 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rhobtb3Q9CTN4 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rhobtb3Q9CTN4 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rhobtb3Q9CTN4 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rhobtb3Q9CTN4 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rhobtb3Q9CTN4 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rhobtb3Q9CTN4 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rhobtb3Q9CTN4 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rhobtb3Q9CTN4 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rhobtb3Q9CTN4 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rhobtb3Q9CTN4 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rhobtb3Q9CTN4 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rhobtb3Q9CTN4 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rhobtb3Q9CTN4 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rhobtb3Q9CTN4 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rhobtb3Q9CTN4 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rhobtb3Q9CTN4 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Rhobtb3Q9CTN4 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rhobtb3Q9CTN4 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rhobtb3Q9CTN4 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rhobtb3Q9CTN4 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rhobtb3Q9CTN4 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rhobtb3Q9CTN4 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rhobtb3Q9CTN4 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rhobtb3Q9CTN4 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rhobtb3Q9CTN4 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms