Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQZ7

Polr3k, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC10, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3kQ9CQZ7 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr3kQ9CQZ7 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr3kQ9CQZ7 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr3kQ9CQZ7 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr3kQ9CQZ7 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr3kQ9CQZ7 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr3kQ9CQZ7 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr3kQ9CQZ7 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr3kQ9CQZ7 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Polr3kQ9CQZ7 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Polr3kQ9CQZ7 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Polr3kQ9CQZ7 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Polr3kQ9CQZ7 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Polr3kQ9CQZ7 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Polr3kQ9CQZ7 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Polr3kQ9CQZ7 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Polr3kQ9CQZ7 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Polr3kQ9CQZ7 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Polr3kQ9CQZ7 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Polr3kQ9CQZ7 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Polr3kQ9CQZ7 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Polr3kQ9CQZ7 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Polr3kQ9CQZ7 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Polr3kQ9CQZ7 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Polr3kQ9CQZ7 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Polr3kQ9CQZ7 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr3kQ9CQZ7 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr3kQ9CQZ7 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr3kQ9CQZ7 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr3kQ9CQZ7 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr3kQ9CQZ7 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr3kQ9CQZ7 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr3kQ9CQZ7 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr3kQ9CQZ7 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr3kQ9CQZ7 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr3kQ9CQZ7 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr3kQ9CQZ7 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr3kQ9CQZ7 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr3kQ9CQZ7 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr3kQ9CQZ7 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr3kQ9CQZ7 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr3kQ9CQZ7 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr3kQ9CQZ7 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr3kQ9CQZ7 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr3kQ9CQZ7 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr3kQ9CQZ7 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr3kQ9CQZ7 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr3kQ9CQZ7 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr3kQ9CQZ7 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr3kQ9CQZ7 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr3kQ9CQZ7 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr3kQ9CQZ7 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr3kQ9CQZ7 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr3kQ9CQZ7 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr3kQ9CQZ7 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr3kQ9CQZ7 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr3kQ9CQZ7 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr3kQ9CQZ7 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr3kQ9CQZ7 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr3kQ9CQZ7 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr3kQ9CQZ7 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr3kQ9CQZ7 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr3kQ9CQZ7 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr3kQ9CQZ7 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr3kQ9CQZ7 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr3kQ9CQZ7 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr3kQ9CQZ7 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr3kQ9CQZ7 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr3kQ9CQZ7 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr3kQ9CQZ7 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr3kQ9CQZ7 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr3kQ9CQZ7 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr3kQ9CQZ7 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr3kQ9CQZ7 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr3kQ9CQZ7 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr3kQ9CQZ7 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr3kQ9CQZ7 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr3kQ9CQZ7 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr3kQ9CQZ7 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr3kQ9CQZ7 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr3kQ9CQZ7 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr3kQ9CQZ7 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr3kQ9CQZ7 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr3kQ9CQZ7 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr3kQ9CQZ7 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr3kQ9CQZ7 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr3kQ9CQZ7 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr3kQ9CQZ7 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr3kQ9CQZ7 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr3kQ9CQZ7 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr3kQ9CQZ7 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr3kQ9CQZ7 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr3kQ9CQZ7 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr3kQ9CQZ7 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr3kQ9CQZ7 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr3kQ9CQZ7 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr3kQ9CQZ7 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr3kQ9CQZ7 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr3kQ9CQZ7 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr3kQ9CQZ7 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms