Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF0

Mrpl11, 39S ribosomal protein L11, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl11Q9CQF0 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mrpl11Q9CQF0 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mrpl11Q9CQF0 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mrpl11Q9CQF0 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mrpl11Q9CQF0 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mrpl11Q9CQF0 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mrpl11Q9CQF0 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mrpl11Q9CQF0 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mrpl11Q9CQF0 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mrpl11Q9CQF0 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mrpl11Q9CQF0 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mrpl11Q9CQF0 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mrpl11Q9CQF0 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mrpl11Q9CQF0 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Mrpl11Q9CQF0 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Mrpl11Q9CQF0 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Mrpl11Q9CQF0 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mrpl11Q9CQF0 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mrpl11Q9CQF0 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Mrpl11Q9CQF0 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mrpl11Q9CQF0 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mrpl11Q9CQF0 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Mrpl11Q9CQF0 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Mrpl11Q9CQF0 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Mrpl11Q9CQF0 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Mrpl11Q9CQF0 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Mrpl11Q9CQF0 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mrpl11Q9CQF0 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mrpl11Q9CQF0 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mrpl11Q9CQF0 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mrpl11Q9CQF0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mrpl11Q9CQF0 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mrpl11Q9CQF0 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mrpl11Q9CQF0 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mrpl11Q9CQF0 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mrpl11Q9CQF0 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Mrpl11Q9CQF0 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mrpl11Q9CQF0 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mrpl11Q9CQF0 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.31■■□□□ 1
Mrpl11Q9CQF0 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Mrpl11Q9CQF0 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mrpl11Q9CQF0 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mrpl11Q9CQF0 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Mrpl11Q9CQF0 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mrpl11Q9CQF0 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mrpl11Q9CQF0 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Mrpl11Q9CQF0 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mrpl11Q9CQF0 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mrpl11Q9CQF0 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mrpl11Q9CQF0 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Mrpl11Q9CQF0 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mrpl11Q9CQF0 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Mrpl11Q9CQF0 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mrpl11Q9CQF0 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mrpl11Q9CQF0 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Mrpl11Q9CQF0 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mrpl11Q9CQF0 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mrpl11Q9CQF0 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mrpl11Q9CQF0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mrpl11Q9CQF0 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mrpl11Q9CQF0 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mrpl11Q9CQF0 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mrpl11Q9CQF0 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Mrpl11Q9CQF0 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Mrpl11Q9CQF0 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Mrpl11Q9CQF0 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mrpl11Q9CQF0 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mrpl11Q9CQF0 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mrpl11Q9CQF0 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mrpl11Q9CQF0 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mrpl11Q9CQF0 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Mrpl11Q9CQF0 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Mrpl11Q9CQF0 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mrpl11Q9CQF0 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mrpl11Q9CQF0 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Mrpl11Q9CQF0 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mrpl11Q9CQF0 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mrpl11Q9CQF0 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mrpl11Q9CQF0 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Mrpl11Q9CQF0 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Mrpl11Q9CQF0 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mrpl11Q9CQF0 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Mrpl11Q9CQF0 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Mrpl11Q9CQF0 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Mrpl11Q9CQF0 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mrpl11Q9CQF0 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Mrpl11Q9CQF0 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Mrpl11Q9CQF0 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Mrpl11Q9CQF0 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mrpl11Q9CQF0 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.27■■□□□ 1
Mrpl11Q9CQF0 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mrpl11Q9CQF0 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mrpl11Q9CQF0 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Mrpl11Q9CQF0 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mrpl11Q9CQF0 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mrpl11Q9CQF0 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mrpl11Q9CQF0 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mrpl11Q9CQF0 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mrpl11Q9CQF0 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mrpl11Q9CQF0 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms