Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700029P11RikQ9CQ68 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700029P11RikQ9CQ68 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700029P11RikQ9CQ68 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700029P11RikQ9CQ68 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700029P11RikQ9CQ68 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700029P11RikQ9CQ68 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700029P11RikQ9CQ68 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700029P11RikQ9CQ68 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms