Protein–RNA interactions for Protein: Q99NC0

Vgll1, Transcription cofactor vestigial-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll1Q99NC0 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vgll1Q99NC0 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vgll1Q99NC0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vgll1Q99NC0 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vgll1Q99NC0 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vgll1Q99NC0 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vgll1Q99NC0 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vgll1Q99NC0 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vgll1Q99NC0 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vgll1Q99NC0 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vgll1Q99NC0 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vgll1Q99NC0 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vgll1Q99NC0 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vgll1Q99NC0 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vgll1Q99NC0 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vgll1Q99NC0 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vgll1Q99NC0 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vgll1Q99NC0 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Vgll1Q99NC0 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vgll1Q99NC0 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vgll1Q99NC0 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vgll1Q99NC0 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vgll1Q99NC0 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vgll1Q99NC0 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Vgll1Q99NC0 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vgll1Q99NC0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vgll1Q99NC0 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vgll1Q99NC0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Vgll1Q99NC0 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Vgll1Q99NC0 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vgll1Q99NC0 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vgll1Q99NC0 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vgll1Q99NC0 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vgll1Q99NC0 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vgll1Q99NC0 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Vgll1Q99NC0 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vgll1Q99NC0 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Vgll1Q99NC0 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vgll1Q99NC0 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vgll1Q99NC0 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Vgll1Q99NC0 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Vgll1Q99NC0 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Vgll1Q99NC0 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Vgll1Q99NC0 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vgll1Q99NC0 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vgll1Q99NC0 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vgll1Q99NC0 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vgll1Q99NC0 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vgll1Q99NC0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vgll1Q99NC0 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vgll1Q99NC0 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vgll1Q99NC0 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vgll1Q99NC0 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vgll1Q99NC0 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vgll1Q99NC0 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vgll1Q99NC0 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vgll1Q99NC0 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vgll1Q99NC0 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vgll1Q99NC0 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vgll1Q99NC0 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Vgll1Q99NC0 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vgll1Q99NC0 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vgll1Q99NC0 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vgll1Q99NC0 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vgll1Q99NC0 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Vgll1Q99NC0 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vgll1Q99NC0 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vgll1Q99NC0 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vgll1Q99NC0 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vgll1Q99NC0 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vgll1Q99NC0 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vgll1Q99NC0 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vgll1Q99NC0 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vgll1Q99NC0 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vgll1Q99NC0 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vgll1Q99NC0 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vgll1Q99NC0 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vgll1Q99NC0 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vgll1Q99NC0 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vgll1Q99NC0 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vgll1Q99NC0 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vgll1Q99NC0 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vgll1Q99NC0 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vgll1Q99NC0 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vgll1Q99NC0 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vgll1Q99NC0 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vgll1Q99NC0 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vgll1Q99NC0 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vgll1Q99NC0 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vgll1Q99NC0 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vgll1Q99NC0 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vgll1Q99NC0 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vgll1Q99NC0 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Vgll1Q99NC0 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vgll1Q99NC0 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vgll1Q99NC0 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vgll1Q99NC0 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vgll1Q99NC0 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vgll1Q99NC0 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vgll1Q99NC0 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms