Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB9

Sf3b1, Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1Q99NB9 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sf3b1Q99NB9 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sf3b1Q99NB9 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sf3b1Q99NB9 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sf3b1Q99NB9 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sf3b1Q99NB9 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sf3b1Q99NB9 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sf3b1Q99NB9 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sf3b1Q99NB9 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Sf3b1Q99NB9 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sf3b1Q99NB9 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sf3b1Q99NB9 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sf3b1Q99NB9 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sf3b1Q99NB9 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sf3b1Q99NB9 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sf3b1Q99NB9 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sf3b1Q99NB9 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Sf3b1Q99NB9 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Sf3b1Q99NB9 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sf3b1Q99NB9 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sf3b1Q99NB9 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sf3b1Q99NB9 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sf3b1Q99NB9 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sf3b1Q99NB9 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sf3b1Q99NB9 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sf3b1Q99NB9 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sf3b1Q99NB9 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sf3b1Q99NB9 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sf3b1Q99NB9 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Sf3b1Q99NB9 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sf3b1Q99NB9 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sf3b1Q99NB9 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sf3b1Q99NB9 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sf3b1Q99NB9 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sf3b1Q99NB9 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sf3b1Q99NB9 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sf3b1Q99NB9 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sf3b1Q99NB9 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sf3b1Q99NB9 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sf3b1Q99NB9 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sf3b1Q99NB9 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sf3b1Q99NB9 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sf3b1Q99NB9 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sf3b1Q99NB9 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Sf3b1Q99NB9 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Sf3b1Q99NB9 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sf3b1Q99NB9 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sf3b1Q99NB9 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sf3b1Q99NB9 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sf3b1Q99NB9 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sf3b1Q99NB9 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sf3b1Q99NB9 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sf3b1Q99NB9 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sf3b1Q99NB9 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sf3b1Q99NB9 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sf3b1Q99NB9 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sf3b1Q99NB9 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sf3b1Q99NB9 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sf3b1Q99NB9 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sf3b1Q99NB9 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sf3b1Q99NB9 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Sf3b1Q99NB9 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sf3b1Q99NB9 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sf3b1Q99NB9 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sf3b1Q99NB9 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sf3b1Q99NB9 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sf3b1Q99NB9 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sf3b1Q99NB9 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sf3b1Q99NB9 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sf3b1Q99NB9 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sf3b1Q99NB9 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sf3b1Q99NB9 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sf3b1Q99NB9 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sf3b1Q99NB9 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sf3b1Q99NB9 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sf3b1Q99NB9 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sf3b1Q99NB9 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Sf3b1Q99NB9 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sf3b1Q99NB9 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Sf3b1Q99NB9 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sf3b1Q99NB9 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sf3b1Q99NB9 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sf3b1Q99NB9 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sf3b1Q99NB9 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sf3b1Q99NB9 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sf3b1Q99NB9 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sf3b1Q99NB9 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sf3b1Q99NB9 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sf3b1Q99NB9 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sf3b1Q99NB9 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sf3b1Q99NB9 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sf3b1Q99NB9 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sf3b1Q99NB9 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Sf3b1Q99NB9 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sf3b1Q99NB9 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sf3b1Q99NB9 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sf3b1Q99NB9 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sf3b1Q99NB9 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sf3b1Q99NB9 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Sf3b1Q99NB9 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms