Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA9

Pcgf6, Polycomb group RING finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf6Q99NA9 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Pcgf6Q99NA9 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Pcgf6Q99NA9 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Pcgf6Q99NA9 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Pcgf6Q99NA9 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Pcgf6Q99NA9 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Pcgf6Q99NA9 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Pcgf6Q99NA9 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Pcgf6Q99NA9 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pcgf6Q99NA9 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pcgf6Q99NA9 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pcgf6Q99NA9 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pcgf6Q99NA9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pcgf6Q99NA9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pcgf6Q99NA9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pcgf6Q99NA9 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pcgf6Q99NA9 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pcgf6Q99NA9 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Pcgf6Q99NA9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Pcgf6Q99NA9 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Pcgf6Q99NA9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Pcgf6Q99NA9 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Pcgf6Q99NA9 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Pcgf6Q99NA9 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Pcgf6Q99NA9 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pcgf6Q99NA9 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pcgf6Q99NA9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Pcgf6Q99NA9 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pcgf6Q99NA9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pcgf6Q99NA9 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pcgf6Q99NA9 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Pcgf6Q99NA9 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pcgf6Q99NA9 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pcgf6Q99NA9 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pcgf6Q99NA9 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pcgf6Q99NA9 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Pcgf6Q99NA9 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Pcgf6Q99NA9 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Pcgf6Q99NA9 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Pcgf6Q99NA9 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Pcgf6Q99NA9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Pcgf6Q99NA9 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Pcgf6Q99NA9 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Pcgf6Q99NA9 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Pcgf6Q99NA9 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pcgf6Q99NA9 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pcgf6Q99NA9 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pcgf6Q99NA9 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pcgf6Q99NA9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pcgf6Q99NA9 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pcgf6Q99NA9 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pcgf6Q99NA9 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pcgf6Q99NA9 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pcgf6Q99NA9 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Pcgf6Q99NA9 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Pcgf6Q99NA9 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Pcgf6Q99NA9 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Pcgf6Q99NA9 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Pcgf6Q99NA9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Pcgf6Q99NA9 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Pcgf6Q99NA9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Pcgf6Q99NA9 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Pcgf6Q99NA9 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Pcgf6Q99NA9 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Pcgf6Q99NA9 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Pcgf6Q99NA9 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Pcgf6Q99NA9 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Pcgf6Q99NA9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Pcgf6Q99NA9 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Pcgf6Q99NA9 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Pcgf6Q99NA9 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Pcgf6Q99NA9 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Pcgf6Q99NA9 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Pcgf6Q99NA9 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Pcgf6Q99NA9 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Pcgf6Q99NA9 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Pcgf6Q99NA9 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Pcgf6Q99NA9 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Pcgf6Q99NA9 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Pcgf6Q99NA9 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Pcgf6Q99NA9 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Pcgf6Q99NA9 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Pcgf6Q99NA9 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Pcgf6Q99NA9 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Pcgf6Q99NA9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Pcgf6Q99NA9 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Pcgf6Q99NA9 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Pcgf6Q99NA9 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Pcgf6Q99NA9 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pcgf6Q99NA9 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pcgf6Q99NA9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pcgf6Q99NA9 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pcgf6Q99NA9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pcgf6Q99NA9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pcgf6Q99NA9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pcgf6Q99NA9 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pcgf6Q99NA9 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pcgf6Q99NA9 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pcgf6Q99NA9 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pcgf6Q99NA9 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms