Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SrrtQ99MR6 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SrrtQ99MR6 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SrrtQ99MR6 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SrrtQ99MR6 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SrrtQ99MR6 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SrrtQ99MR6 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SrrtQ99MR6 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SrrtQ99MR6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SrrtQ99MR6 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SrrtQ99MR6 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SrrtQ99MR6 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SrrtQ99MR6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SrrtQ99MR6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SrrtQ99MR6 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SrrtQ99MR6 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SrrtQ99MR6 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SrrtQ99MR6 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SrrtQ99MR6 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SrrtQ99MR6 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SrrtQ99MR6 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SrrtQ99MR6 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SrrtQ99MR6 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SrrtQ99MR6 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SrrtQ99MR6 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SrrtQ99MR6 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SrrtQ99MR6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SrrtQ99MR6 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SrrtQ99MR6 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SrrtQ99MR6 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SrrtQ99MR6 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SrrtQ99MR6 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SrrtQ99MR6 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SrrtQ99MR6 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SrrtQ99MR6 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SrrtQ99MR6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SrrtQ99MR6 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SrrtQ99MR6 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SrrtQ99MR6 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SrrtQ99MR6 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SrrtQ99MR6 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SrrtQ99MR6 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SrrtQ99MR6 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SrrtQ99MR6 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SrrtQ99MR6 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SrrtQ99MR6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SrrtQ99MR6 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SrrtQ99MR6 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SrrtQ99MR6 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SrrtQ99MR6 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SrrtQ99MR6 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SrrtQ99MR6 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SrrtQ99MR6 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SrrtQ99MR6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SrrtQ99MR6 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SrrtQ99MR6 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SrrtQ99MR6 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SrrtQ99MR6 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SrrtQ99MR6 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SrrtQ99MR6 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SrrtQ99MR6 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SrrtQ99MR6 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SrrtQ99MR6 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SrrtQ99MR6 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SrrtQ99MR6 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SrrtQ99MR6 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SrrtQ99MR6 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SrrtQ99MR6 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SrrtQ99MR6 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SrrtQ99MR6 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SrrtQ99MR6 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SrrtQ99MR6 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SrrtQ99MR6 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SrrtQ99MR6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SrrtQ99MR6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SrrtQ99MR6 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SrrtQ99MR6 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SrrtQ99MR6 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SrrtQ99MR6 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SrrtQ99MR6 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SrrtQ99MR6 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SrrtQ99MR6 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SrrtQ99MR6 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SrrtQ99MR6 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SrrtQ99MR6 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SrrtQ99MR6 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SrrtQ99MR6 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SrrtQ99MR6 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SrrtQ99MR6 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SrrtQ99MR6 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SrrtQ99MR6 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SrrtQ99MR6 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC21.33■■□□□ 1
SrrtQ99MR6 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SrrtQ99MR6 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SrrtQ99MR6 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SrrtQ99MR6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SrrtQ99MR6 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SrrtQ99MR6 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SrrtQ99MR6 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SrrtQ99MR6 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms