Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Atp1b4Q99ME6 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Atp1b4Q99ME6 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Atp1b4Q99ME6 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Atp1b4Q99ME6 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Atp1b4Q99ME6 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Atp1b4Q99ME6 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Atp1b4Q99ME6 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Atp1b4Q99ME6 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Atp1b4Q99ME6 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Atp1b4Q99ME6 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Atp1b4Q99ME6 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Atp1b4Q99ME6 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Atp1b4Q99ME6 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Atp1b4Q99ME6 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Atp1b4Q99ME6 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Atp1b4Q99ME6 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Atp1b4Q99ME6 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Atp1b4Q99ME6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Atp1b4Q99ME6 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Atp1b4Q99ME6 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Atp1b4Q99ME6 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Atp1b4Q99ME6 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Atp1b4Q99ME6 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Atp1b4Q99ME6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Atp1b4Q99ME6 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Atp1b4Q99ME6 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Atp1b4Q99ME6 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Atp1b4Q99ME6 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Atp1b4Q99ME6 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Atp1b4Q99ME6 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Atp1b4Q99ME6 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Atp1b4Q99ME6 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Atp1b4Q99ME6 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Atp1b4Q99ME6 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Atp1b4Q99ME6 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Atp1b4Q99ME6 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Atp1b4Q99ME6 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Atp1b4Q99ME6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Atp1b4Q99ME6 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Atp1b4Q99ME6 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Atp1b4Q99ME6 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Atp1b4Q99ME6 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Atp1b4Q99ME6 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Atp1b4Q99ME6 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Atp1b4Q99ME6 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Atp1b4Q99ME6 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Atp1b4Q99ME6 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Atp1b4Q99ME6 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Atp1b4Q99ME6 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Atp1b4Q99ME6 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Atp1b4Q99ME6 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Atp1b4Q99ME6 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Atp1b4Q99ME6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Atp1b4Q99ME6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Atp1b4Q99ME6 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Atp1b4Q99ME6 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Atp1b4Q99ME6 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Atp1b4Q99ME6 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Atp1b4Q99ME6 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Atp1b4Q99ME6 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Atp1b4Q99ME6 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Atp1b4Q99ME6 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Atp1b4Q99ME6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Atp1b4Q99ME6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Atp1b4Q99ME6 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Atp1b4Q99ME6 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Atp1b4Q99ME6 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Atp1b4Q99ME6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Atp1b4Q99ME6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Atp1b4Q99ME6 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Atp1b4Q99ME6 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Atp1b4Q99ME6 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Atp1b4Q99ME6 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Atp1b4Q99ME6 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Atp1b4Q99ME6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Atp1b4Q99ME6 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Atp1b4Q99ME6 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Atp1b4Q99ME6 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Atp1b4Q99ME6 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Atp1b4Q99ME6 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Atp1b4Q99ME6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Atp1b4Q99ME6 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Atp1b4Q99ME6 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Atp1b4Q99ME6 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Atp1b4Q99ME6 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Atp1b4Q99ME6 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Atp1b4Q99ME6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Atp1b4Q99ME6 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Atp1b4Q99ME6 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Atp1b4Q99ME6 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Atp1b4Q99ME6 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Atp1b4Q99ME6 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Atp1b4Q99ME6 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Atp1b4Q99ME6 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Atp1b4Q99ME6 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Atp1b4Q99ME6 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Atp1b4Q99ME6 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Atp1b4Q99ME6 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Atp1b4Q99ME6 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms