Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pagr1aQ99L02 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pagr1aQ99L02 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pagr1aQ99L02 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pagr1aQ99L02 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pagr1aQ99L02 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Pagr1aQ99L02 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pagr1aQ99L02 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pagr1aQ99L02 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pagr1aQ99L02 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pagr1aQ99L02 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pagr1aQ99L02 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pagr1aQ99L02 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pagr1aQ99L02 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pagr1aQ99L02 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pagr1aQ99L02 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pagr1aQ99L02 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pagr1aQ99L02 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pagr1aQ99L02 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pagr1aQ99L02 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pagr1aQ99L02 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pagr1aQ99L02 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pagr1aQ99L02 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pagr1aQ99L02 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pagr1aQ99L02 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pagr1aQ99L02 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pagr1aQ99L02 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pagr1aQ99L02 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Pagr1aQ99L02 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pagr1aQ99L02 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pagr1aQ99L02 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pagr1aQ99L02 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pagr1aQ99L02 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pagr1aQ99L02 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pagr1aQ99L02 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pagr1aQ99L02 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pagr1aQ99L02 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pagr1aQ99L02 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pagr1aQ99L02 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Pagr1aQ99L02 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pagr1aQ99L02 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Pagr1aQ99L02 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pagr1aQ99L02 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pagr1aQ99L02 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pagr1aQ99L02 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pagr1aQ99L02 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pagr1aQ99L02 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pagr1aQ99L02 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pagr1aQ99L02 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pagr1aQ99L02 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pagr1aQ99L02 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Pagr1aQ99L02 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pagr1aQ99L02 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pagr1aQ99L02 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pagr1aQ99L02 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pagr1aQ99L02 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pagr1aQ99L02 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pagr1aQ99L02 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pagr1aQ99L02 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pagr1aQ99L02 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pagr1aQ99L02 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pagr1aQ99L02 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pagr1aQ99L02 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pagr1aQ99L02 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pagr1aQ99L02 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pagr1aQ99L02 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pagr1aQ99L02 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Pagr1aQ99L02 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pagr1aQ99L02 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pagr1aQ99L02 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pagr1aQ99L02 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pagr1aQ99L02 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Pagr1aQ99L02 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pagr1aQ99L02 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Pagr1aQ99L02 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pagr1aQ99L02 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pagr1aQ99L02 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pagr1aQ99L02 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pagr1aQ99L02 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pagr1aQ99L02 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pagr1aQ99L02 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pagr1aQ99L02 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pagr1aQ99L02 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pagr1aQ99L02 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pagr1aQ99L02 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pagr1aQ99L02 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pagr1aQ99L02 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pagr1aQ99L02 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Pagr1aQ99L02 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pagr1aQ99L02 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pagr1aQ99L02 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pagr1aQ99L02 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pagr1aQ99L02 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pagr1aQ99L02 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pagr1aQ99L02 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pagr1aQ99L02 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pagr1aQ99L02 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pagr1aQ99L02 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pagr1aQ99L02 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pagr1aQ99L02 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms