Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ciao1Q99KN2 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ciao1Q99KN2 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ciao1Q99KN2 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ciao1Q99KN2 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ciao1Q99KN2 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ciao1Q99KN2 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ciao1Q99KN2 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ciao1Q99KN2 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ciao1Q99KN2 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ciao1Q99KN2 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ciao1Q99KN2 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ciao1Q99KN2 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ciao1Q99KN2 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ciao1Q99KN2 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ciao1Q99KN2 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ciao1Q99KN2 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ciao1Q99KN2 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ciao1Q99KN2 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ciao1Q99KN2 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ciao1Q99KN2 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ciao1Q99KN2 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ciao1Q99KN2 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ciao1Q99KN2 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ciao1Q99KN2 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ciao1Q99KN2 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ciao1Q99KN2 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ciao1Q99KN2 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ciao1Q99KN2 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ciao1Q99KN2 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ciao1Q99KN2 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ciao1Q99KN2 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ciao1Q99KN2 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ciao1Q99KN2 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ciao1Q99KN2 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ciao1Q99KN2 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ciao1Q99KN2 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ciao1Q99KN2 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ciao1Q99KN2 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ciao1Q99KN2 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ciao1Q99KN2 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ciao1Q99KN2 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ciao1Q99KN2 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ciao1Q99KN2 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ciao1Q99KN2 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ciao1Q99KN2 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ciao1Q99KN2 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ciao1Q99KN2 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ciao1Q99KN2 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ciao1Q99KN2 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ciao1Q99KN2 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ciao1Q99KN2 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ciao1Q99KN2 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ciao1Q99KN2 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ciao1Q99KN2 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ciao1Q99KN2 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ciao1Q99KN2 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ciao1Q99KN2 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ciao1Q99KN2 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ciao1Q99KN2 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ciao1Q99KN2 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ciao1Q99KN2 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ciao1Q99KN2 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ciao1Q99KN2 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ciao1Q99KN2 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ciao1Q99KN2 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ciao1Q99KN2 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ciao1Q99KN2 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ciao1Q99KN2 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ciao1Q99KN2 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ciao1Q99KN2 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ciao1Q99KN2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ciao1Q99KN2 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ciao1Q99KN2 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ciao1Q99KN2 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ciao1Q99KN2 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ciao1Q99KN2 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ciao1Q99KN2 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ciao1Q99KN2 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ciao1Q99KN2 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ciao1Q99KN2 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ciao1Q99KN2 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ciao1Q99KN2 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ciao1Q99KN2 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ciao1Q99KN2 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ciao1Q99KN2 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ciao1Q99KN2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ciao1Q99KN2 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ciao1Q99KN2 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ciao1Q99KN2 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ciao1Q99KN2 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ciao1Q99KN2 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ciao1Q99KN2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ciao1Q99KN2 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ciao1Q99KN2 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ciao1Q99KN2 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ciao1Q99KN2 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ciao1Q99KN2 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ciao1Q99KN2 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ciao1Q99KN2 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms