Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn16Q925N4 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn16Q925N4 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn16Q925N4 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn16Q925N4 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn16Q925N4 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn16Q925N4 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn16Q925N4 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn16Q925N4 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn16Q925N4 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn16Q925N4 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn16Q925N4 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn16Q925N4 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn16Q925N4 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn16Q925N4 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn16Q925N4 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn16Q925N4 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn16Q925N4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn16Q925N4 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn16Q925N4 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn16Q925N4 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn16Q925N4 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn16Q925N4 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn16Q925N4 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn16Q925N4 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn16Q925N4 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn16Q925N4 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn16Q925N4 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn16Q925N4 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn16Q925N4 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn16Q925N4 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn16Q925N4 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn16Q925N4 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn16Q925N4 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn16Q925N4 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn16Q925N4 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn16Q925N4 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn16Q925N4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn16Q925N4 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn16Q925N4 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn16Q925N4 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn16Q925N4 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn16Q925N4 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn16Q925N4 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn16Q925N4 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn16Q925N4 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn16Q925N4 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn16Q925N4 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn16Q925N4 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn16Q925N4 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn16Q925N4 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn16Q925N4 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn16Q925N4 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn16Q925N4 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn16Q925N4 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn16Q925N4 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn16Q925N4 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn16Q925N4 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn16Q925N4 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn16Q925N4 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn16Q925N4 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn16Q925N4 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn16Q925N4 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn16Q925N4 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn16Q925N4 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn16Q925N4 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn16Q925N4 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn16Q925N4 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn16Q925N4 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn16Q925N4 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn16Q925N4 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn16Q925N4 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn16Q925N4 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn16Q925N4 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn16Q925N4 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn16Q925N4 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn16Q925N4 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn16Q925N4 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn16Q925N4 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn16Q925N4 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn16Q925N4 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn16Q925N4 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn16Q925N4 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn16Q925N4 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn16Q925N4 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cldn16Q925N4 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cldn16Q925N4 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cldn16Q925N4 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cldn16Q925N4 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cldn16Q925N4 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cldn16Q925N4 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn16Q925N4 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn16Q925N4 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn16Q925N4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn16Q925N4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn16Q925N4 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn16Q925N4 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn16Q925N4 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn16Q925N4 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn16Q925N4 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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