Protein–RNA interactions for Protein: Q91VB4

Hps3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,002 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps3Q91VB4 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Hps3Q91VB4 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Hps3Q91VB4 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hps3Q91VB4 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hps3Q91VB4 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hps3Q91VB4 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Hps3Q91VB4 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Hps3Q91VB4 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Hps3Q91VB4 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hps3Q91VB4 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hps3Q91VB4 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hps3Q91VB4 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hps3Q91VB4 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hps3Q91VB4 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hps3Q91VB4 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hps3Q91VB4 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hps3Q91VB4 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hps3Q91VB4 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hps3Q91VB4 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hps3Q91VB4 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hps3Q91VB4 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hps3Q91VB4 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hps3Q91VB4 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hps3Q91VB4 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hps3Q91VB4 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hps3Q91VB4 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hps3Q91VB4 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hps3Q91VB4 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hps3Q91VB4 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hps3Q91VB4 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hps3Q91VB4 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hps3Q91VB4 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hps3Q91VB4 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hps3Q91VB4 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hps3Q91VB4 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hps3Q91VB4 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hps3Q91VB4 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hps3Q91VB4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hps3Q91VB4 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hps3Q91VB4 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hps3Q91VB4 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hps3Q91VB4 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hps3Q91VB4 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hps3Q91VB4 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hps3Q91VB4 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hps3Q91VB4 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hps3Q91VB4 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hps3Q91VB4 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hps3Q91VB4 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hps3Q91VB4 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hps3Q91VB4 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hps3Q91VB4 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hps3Q91VB4 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hps3Q91VB4 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hps3Q91VB4 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Hps3Q91VB4 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hps3Q91VB4 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hps3Q91VB4 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hps3Q91VB4 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hps3Q91VB4 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hps3Q91VB4 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hps3Q91VB4 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hps3Q91VB4 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hps3Q91VB4 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hps3Q91VB4 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hps3Q91VB4 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hps3Q91VB4 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hps3Q91VB4 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hps3Q91VB4 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hps3Q91VB4 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hps3Q91VB4 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hps3Q91VB4 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hps3Q91VB4 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hps3Q91VB4 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hps3Q91VB4 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hps3Q91VB4 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hps3Q91VB4 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hps3Q91VB4 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hps3Q91VB4 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hps3Q91VB4 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hps3Q91VB4 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hps3Q91VB4 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hps3Q91VB4 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hps3Q91VB4 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hps3Q91VB4 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hps3Q91VB4 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hps3Q91VB4 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hps3Q91VB4 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hps3Q91VB4 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hps3Q91VB4 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hps3Q91VB4 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hps3Q91VB4 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hps3Q91VB4 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Hps3Q91VB4 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hps3Q91VB4 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hps3Q91VB4 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hps3Q91VB4 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Hps3Q91VB4 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hps3Q91VB4 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hps3Q91VB4 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms