Protein–RNA interactions for Protein: Q8VI88

Odf4, Outer dense fiber protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf4Q8VI88 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Odf4Q8VI88 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Odf4Q8VI88 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Odf4Q8VI88 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Odf4Q8VI88 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Odf4Q8VI88 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Odf4Q8VI88 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Odf4Q8VI88 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Odf4Q8VI88 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Odf4Q8VI88 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Odf4Q8VI88 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Odf4Q8VI88 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Odf4Q8VI88 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Odf4Q8VI88 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Odf4Q8VI88 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Odf4Q8VI88 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Odf4Q8VI88 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Odf4Q8VI88 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Odf4Q8VI88 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Odf4Q8VI88 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Odf4Q8VI88 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Odf4Q8VI88 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Odf4Q8VI88 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Odf4Q8VI88 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Odf4Q8VI88 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Odf4Q8VI88 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Odf4Q8VI88 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Odf4Q8VI88 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Odf4Q8VI88 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Odf4Q8VI88 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Odf4Q8VI88 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Odf4Q8VI88 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Odf4Q8VI88 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Odf4Q8VI88 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Odf4Q8VI88 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Odf4Q8VI88 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Odf4Q8VI88 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Odf4Q8VI88 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Odf4Q8VI88 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Odf4Q8VI88 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Odf4Q8VI88 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Odf4Q8VI88 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Odf4Q8VI88 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Odf4Q8VI88 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Odf4Q8VI88 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Odf4Q8VI88 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Odf4Q8VI88 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Odf4Q8VI88 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Odf4Q8VI88 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Odf4Q8VI88 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Odf4Q8VI88 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Odf4Q8VI88 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Odf4Q8VI88 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Odf4Q8VI88 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Odf4Q8VI88 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Odf4Q8VI88 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Odf4Q8VI88 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Odf4Q8VI88 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Odf4Q8VI88 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Odf4Q8VI88 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Odf4Q8VI88 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Odf4Q8VI88 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Odf4Q8VI88 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Odf4Q8VI88 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Odf4Q8VI88 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Odf4Q8VI88 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Odf4Q8VI88 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Odf4Q8VI88 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Odf4Q8VI88 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Odf4Q8VI88 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Odf4Q8VI88 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Odf4Q8VI88 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Odf4Q8VI88 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Odf4Q8VI88 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Odf4Q8VI88 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Odf4Q8VI88 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Odf4Q8VI88 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Odf4Q8VI88 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Odf4Q8VI88 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Odf4Q8VI88 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Odf4Q8VI88 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Odf4Q8VI88 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Odf4Q8VI88 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Odf4Q8VI88 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Odf4Q8VI88 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Odf4Q8VI88 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Odf4Q8VI88 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Odf4Q8VI88 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Odf4Q8VI88 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Odf4Q8VI88 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Odf4Q8VI88 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Odf4Q8VI88 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Odf4Q8VI88 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Odf4Q8VI88 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Odf4Q8VI88 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Odf4Q8VI88 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Odf4Q8VI88 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Odf4Q8VI88 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Odf4Q8VI88 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Odf4Q8VI88 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms