Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE1

Dnajc28, DnaJ homolog subfamily C member 28, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc28Q8VCE1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dnajc28Q8VCE1 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dnajc28Q8VCE1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dnajc28Q8VCE1 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dnajc28Q8VCE1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dnajc28Q8VCE1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dnajc28Q8VCE1 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dnajc28Q8VCE1 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dnajc28Q8VCE1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dnajc28Q8VCE1 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dnajc28Q8VCE1 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dnajc28Q8VCE1 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dnajc28Q8VCE1 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dnajc28Q8VCE1 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dnajc28Q8VCE1 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dnajc28Q8VCE1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dnajc28Q8VCE1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dnajc28Q8VCE1 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dnajc28Q8VCE1 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dnajc28Q8VCE1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dnajc28Q8VCE1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dnajc28Q8VCE1 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dnajc28Q8VCE1 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dnajc28Q8VCE1 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dnajc28Q8VCE1 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Dnajc28Q8VCE1 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Dnajc28Q8VCE1 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dnajc28Q8VCE1 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dnajc28Q8VCE1 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dnajc28Q8VCE1 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dnajc28Q8VCE1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dnajc28Q8VCE1 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dnajc28Q8VCE1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dnajc28Q8VCE1 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dnajc28Q8VCE1 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dnajc28Q8VCE1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dnajc28Q8VCE1 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dnajc28Q8VCE1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dnajc28Q8VCE1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dnajc28Q8VCE1 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dnajc28Q8VCE1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dnajc28Q8VCE1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dnajc28Q8VCE1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dnajc28Q8VCE1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dnajc28Q8VCE1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dnajc28Q8VCE1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dnajc28Q8VCE1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dnajc28Q8VCE1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dnajc28Q8VCE1 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dnajc28Q8VCE1 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dnajc28Q8VCE1 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dnajc28Q8VCE1 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dnajc28Q8VCE1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dnajc28Q8VCE1 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dnajc28Q8VCE1 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dnajc28Q8VCE1 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dnajc28Q8VCE1 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dnajc28Q8VCE1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dnajc28Q8VCE1 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dnajc28Q8VCE1 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dnajc28Q8VCE1 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Dnajc28Q8VCE1 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dnajc28Q8VCE1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dnajc28Q8VCE1 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dnajc28Q8VCE1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dnajc28Q8VCE1 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dnajc28Q8VCE1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dnajc28Q8VCE1 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dnajc28Q8VCE1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dnajc28Q8VCE1 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dnajc28Q8VCE1 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dnajc28Q8VCE1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dnajc28Q8VCE1 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dnajc28Q8VCE1 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dnajc28Q8VCE1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dnajc28Q8VCE1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dnajc28Q8VCE1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dnajc28Q8VCE1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dnajc28Q8VCE1 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dnajc28Q8VCE1 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dnajc28Q8VCE1 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dnajc28Q8VCE1 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dnajc28Q8VCE1 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dnajc28Q8VCE1 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dnajc28Q8VCE1 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dnajc28Q8VCE1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dnajc28Q8VCE1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dnajc28Q8VCE1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dnajc28Q8VCE1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dnajc28Q8VCE1 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dnajc28Q8VCE1 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Dnajc28Q8VCE1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dnajc28Q8VCE1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dnajc28Q8VCE1 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dnajc28Q8VCE1 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dnajc28Q8VCE1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dnajc28Q8VCE1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dnajc28Q8VCE1 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dnajc28Q8VCE1 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dnajc28Q8VCE1 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms