Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZZ7

Tprkb, EKC/KEOPS complex subunit Tprkb, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TprkbQ8QZZ7 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TprkbQ8QZZ7 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TprkbQ8QZZ7 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TprkbQ8QZZ7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TprkbQ8QZZ7 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TprkbQ8QZZ7 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TprkbQ8QZZ7 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TprkbQ8QZZ7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TprkbQ8QZZ7 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TprkbQ8QZZ7 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TprkbQ8QZZ7 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TprkbQ8QZZ7 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TprkbQ8QZZ7 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TprkbQ8QZZ7 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TprkbQ8QZZ7 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TprkbQ8QZZ7 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TprkbQ8QZZ7 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TprkbQ8QZZ7 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TprkbQ8QZZ7 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TprkbQ8QZZ7 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TprkbQ8QZZ7 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TprkbQ8QZZ7 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TprkbQ8QZZ7 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TprkbQ8QZZ7 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TprkbQ8QZZ7 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TprkbQ8QZZ7 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TprkbQ8QZZ7 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TprkbQ8QZZ7 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TprkbQ8QZZ7 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TprkbQ8QZZ7 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TprkbQ8QZZ7 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TprkbQ8QZZ7 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TprkbQ8QZZ7 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TprkbQ8QZZ7 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TprkbQ8QZZ7 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TprkbQ8QZZ7 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TprkbQ8QZZ7 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TprkbQ8QZZ7 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TprkbQ8QZZ7 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TprkbQ8QZZ7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TprkbQ8QZZ7 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TprkbQ8QZZ7 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TprkbQ8QZZ7 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TprkbQ8QZZ7 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TprkbQ8QZZ7 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TprkbQ8QZZ7 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TprkbQ8QZZ7 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TprkbQ8QZZ7 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TprkbQ8QZZ7 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TprkbQ8QZZ7 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TprkbQ8QZZ7 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TprkbQ8QZZ7 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TprkbQ8QZZ7 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TprkbQ8QZZ7 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TprkbQ8QZZ7 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TprkbQ8QZZ7 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TprkbQ8QZZ7 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TprkbQ8QZZ7 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TprkbQ8QZZ7 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TprkbQ8QZZ7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TprkbQ8QZZ7 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TprkbQ8QZZ7 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TprkbQ8QZZ7 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TprkbQ8QZZ7 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TprkbQ8QZZ7 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TprkbQ8QZZ7 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TprkbQ8QZZ7 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TprkbQ8QZZ7 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TprkbQ8QZZ7 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TprkbQ8QZZ7 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TprkbQ8QZZ7 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TprkbQ8QZZ7 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TprkbQ8QZZ7 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TprkbQ8QZZ7 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TprkbQ8QZZ7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TprkbQ8QZZ7 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TprkbQ8QZZ7 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TprkbQ8QZZ7 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TprkbQ8QZZ7 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TprkbQ8QZZ7 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TprkbQ8QZZ7 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TprkbQ8QZZ7 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TprkbQ8QZZ7 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TprkbQ8QZZ7 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TprkbQ8QZZ7 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TprkbQ8QZZ7 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TprkbQ8QZZ7 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TprkbQ8QZZ7 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TprkbQ8QZZ7 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TprkbQ8QZZ7 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TprkbQ8QZZ7 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TprkbQ8QZZ7 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TprkbQ8QZZ7 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TprkbQ8QZZ7 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TprkbQ8QZZ7 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TprkbQ8QZZ7 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TprkbQ8QZZ7 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TprkbQ8QZZ7 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TprkbQ8QZZ7 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TprkbQ8QZZ7 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms