Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZY9

Sf3b4, Splicing factor 3B subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b4Q8QZY9 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sf3b4Q8QZY9 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sf3b4Q8QZY9 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sf3b4Q8QZY9 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sf3b4Q8QZY9 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sf3b4Q8QZY9 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sf3b4Q8QZY9 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sf3b4Q8QZY9 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sf3b4Q8QZY9 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Sf3b4Q8QZY9 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sf3b4Q8QZY9 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sf3b4Q8QZY9 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sf3b4Q8QZY9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sf3b4Q8QZY9 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sf3b4Q8QZY9 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sf3b4Q8QZY9 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sf3b4Q8QZY9 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sf3b4Q8QZY9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sf3b4Q8QZY9 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sf3b4Q8QZY9 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sf3b4Q8QZY9 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sf3b4Q8QZY9 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sf3b4Q8QZY9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sf3b4Q8QZY9 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sf3b4Q8QZY9 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sf3b4Q8QZY9 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sf3b4Q8QZY9 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sf3b4Q8QZY9 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sf3b4Q8QZY9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sf3b4Q8QZY9 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sf3b4Q8QZY9 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sf3b4Q8QZY9 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sf3b4Q8QZY9 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sf3b4Q8QZY9 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Sf3b4Q8QZY9 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sf3b4Q8QZY9 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Sf3b4Q8QZY9 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sf3b4Q8QZY9 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sf3b4Q8QZY9 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sf3b4Q8QZY9 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sf3b4Q8QZY9 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sf3b4Q8QZY9 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sf3b4Q8QZY9 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sf3b4Q8QZY9 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Sf3b4Q8QZY9 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sf3b4Q8QZY9 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sf3b4Q8QZY9 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sf3b4Q8QZY9 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sf3b4Q8QZY9 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Sf3b4Q8QZY9 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sf3b4Q8QZY9 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sf3b4Q8QZY9 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Sf3b4Q8QZY9 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sf3b4Q8QZY9 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sf3b4Q8QZY9 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sf3b4Q8QZY9 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sf3b4Q8QZY9 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sf3b4Q8QZY9 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sf3b4Q8QZY9 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sf3b4Q8QZY9 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sf3b4Q8QZY9 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Sf3b4Q8QZY9 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sf3b4Q8QZY9 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sf3b4Q8QZY9 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sf3b4Q8QZY9 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sf3b4Q8QZY9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sf3b4Q8QZY9 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Sf3b4Q8QZY9 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sf3b4Q8QZY9 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sf3b4Q8QZY9 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sf3b4Q8QZY9 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sf3b4Q8QZY9 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sf3b4Q8QZY9 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sf3b4Q8QZY9 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sf3b4Q8QZY9 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sf3b4Q8QZY9 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sf3b4Q8QZY9 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sf3b4Q8QZY9 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sf3b4Q8QZY9 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sf3b4Q8QZY9 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sf3b4Q8QZY9 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sf3b4Q8QZY9 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sf3b4Q8QZY9 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sf3b4Q8QZY9 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sf3b4Q8QZY9 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sf3b4Q8QZY9 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sf3b4Q8QZY9 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sf3b4Q8QZY9 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sf3b4Q8QZY9 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sf3b4Q8QZY9 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sf3b4Q8QZY9 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sf3b4Q8QZY9 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sf3b4Q8QZY9 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sf3b4Q8QZY9 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sf3b4Q8QZY9 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sf3b4Q8QZY9 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sf3b4Q8QZY9 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sf3b4Q8QZY9 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sf3b4Q8QZY9 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sf3b4Q8QZY9 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms