Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4Q8

Colec12, Collectin-12, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec12Q8K4Q8 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Colec12Q8K4Q8 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Colec12Q8K4Q8 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Colec12Q8K4Q8 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Colec12Q8K4Q8 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Colec12Q8K4Q8 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Colec12Q8K4Q8 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Colec12Q8K4Q8 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Colec12Q8K4Q8 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Colec12Q8K4Q8 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Colec12Q8K4Q8 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Colec12Q8K4Q8 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Colec12Q8K4Q8 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Colec12Q8K4Q8 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Colec12Q8K4Q8 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Colec12Q8K4Q8 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Colec12Q8K4Q8 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Colec12Q8K4Q8 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Colec12Q8K4Q8 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Colec12Q8K4Q8 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Colec12Q8K4Q8 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Colec12Q8K4Q8 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Colec12Q8K4Q8 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Colec12Q8K4Q8 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Colec12Q8K4Q8 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Colec12Q8K4Q8 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Colec12Q8K4Q8 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Colec12Q8K4Q8 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Colec12Q8K4Q8 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Colec12Q8K4Q8 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Colec12Q8K4Q8 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Colec12Q8K4Q8 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Colec12Q8K4Q8 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Colec12Q8K4Q8 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Colec12Q8K4Q8 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Colec12Q8K4Q8 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Colec12Q8K4Q8 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Colec12Q8K4Q8 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Colec12Q8K4Q8 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Colec12Q8K4Q8 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Colec12Q8K4Q8 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Colec12Q8K4Q8 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Colec12Q8K4Q8 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Colec12Q8K4Q8 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Colec12Q8K4Q8 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Colec12Q8K4Q8 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Colec12Q8K4Q8 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Colec12Q8K4Q8 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Colec12Q8K4Q8 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Colec12Q8K4Q8 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Colec12Q8K4Q8 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Colec12Q8K4Q8 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Colec12Q8K4Q8 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Colec12Q8K4Q8 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Colec12Q8K4Q8 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Colec12Q8K4Q8 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Colec12Q8K4Q8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Colec12Q8K4Q8 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Colec12Q8K4Q8 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Colec12Q8K4Q8 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Colec12Q8K4Q8 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Colec12Q8K4Q8 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Colec12Q8K4Q8 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Colec12Q8K4Q8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Colec12Q8K4Q8 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Colec12Q8K4Q8 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Colec12Q8K4Q8 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Colec12Q8K4Q8 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Colec12Q8K4Q8 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Colec12Q8K4Q8 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Colec12Q8K4Q8 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Colec12Q8K4Q8 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Colec12Q8K4Q8 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Colec12Q8K4Q8 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Colec12Q8K4Q8 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Colec12Q8K4Q8 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Colec12Q8K4Q8 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Colec12Q8K4Q8 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Colec12Q8K4Q8 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Colec12Q8K4Q8 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Colec12Q8K4Q8 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Colec12Q8K4Q8 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Colec12Q8K4Q8 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Colec12Q8K4Q8 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Colec12Q8K4Q8 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Colec12Q8K4Q8 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Colec12Q8K4Q8 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Colec12Q8K4Q8 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Colec12Q8K4Q8 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Colec12Q8K4Q8 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Colec12Q8K4Q8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Colec12Q8K4Q8 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Colec12Q8K4Q8 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Colec12Q8K4Q8 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Colec12Q8K4Q8 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Colec12Q8K4Q8 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Colec12Q8K4Q8 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Colec12Q8K4Q8 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Colec12Q8K4Q8 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Colec12Q8K4Q8 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms