Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3J1

Ndufs8, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 8, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufs8Q8K3J1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndufs8Q8K3J1 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndufs8Q8K3J1 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndufs8Q8K3J1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndufs8Q8K3J1 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndufs8Q8K3J1 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndufs8Q8K3J1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndufs8Q8K3J1 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndufs8Q8K3J1 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndufs8Q8K3J1 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndufs8Q8K3J1 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndufs8Q8K3J1 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndufs8Q8K3J1 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndufs8Q8K3J1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndufs8Q8K3J1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndufs8Q8K3J1 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufs8Q8K3J1 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufs8Q8K3J1 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufs8Q8K3J1 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufs8Q8K3J1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufs8Q8K3J1 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufs8Q8K3J1 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufs8Q8K3J1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufs8Q8K3J1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufs8Q8K3J1 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufs8Q8K3J1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufs8Q8K3J1 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufs8Q8K3J1 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufs8Q8K3J1 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufs8Q8K3J1 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufs8Q8K3J1 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufs8Q8K3J1 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufs8Q8K3J1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufs8Q8K3J1 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufs8Q8K3J1 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufs8Q8K3J1 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufs8Q8K3J1 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufs8Q8K3J1 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufs8Q8K3J1 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufs8Q8K3J1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufs8Q8K3J1 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufs8Q8K3J1 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufs8Q8K3J1 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufs8Q8K3J1 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufs8Q8K3J1 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufs8Q8K3J1 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufs8Q8K3J1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufs8Q8K3J1 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufs8Q8K3J1 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufs8Q8K3J1 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufs8Q8K3J1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufs8Q8K3J1 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufs8Q8K3J1 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufs8Q8K3J1 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufs8Q8K3J1 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufs8Q8K3J1 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufs8Q8K3J1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufs8Q8K3J1 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufs8Q8K3J1 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufs8Q8K3J1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufs8Q8K3J1 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufs8Q8K3J1 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufs8Q8K3J1 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufs8Q8K3J1 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufs8Q8K3J1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufs8Q8K3J1 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufs8Q8K3J1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufs8Q8K3J1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufs8Q8K3J1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufs8Q8K3J1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufs8Q8K3J1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufs8Q8K3J1 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufs8Q8K3J1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufs8Q8K3J1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufs8Q8K3J1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufs8Q8K3J1 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufs8Q8K3J1 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufs8Q8K3J1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufs8Q8K3J1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufs8Q8K3J1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufs8Q8K3J1 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufs8Q8K3J1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufs8Q8K3J1 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufs8Q8K3J1 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufs8Q8K3J1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufs8Q8K3J1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ndufs8Q8K3J1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ndufs8Q8K3J1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ndufs8Q8K3J1 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ndufs8Q8K3J1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ndufs8Q8K3J1 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ndufs8Q8K3J1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ndufs8Q8K3J1 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ndufs8Q8K3J1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ndufs8Q8K3J1 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ndufs8Q8K3J1 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ndufs8Q8K3J1 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ndufs8Q8K3J1 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ndufs8Q8K3J1 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ndufs8Q8K3J1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms