Protein–RNA interactions for Protein: Q8K284

Gtf3c1, General transcription factor 3C polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c1Q8K284 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtf3c1Q8K284 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtf3c1Q8K284 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtf3c1Q8K284 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtf3c1Q8K284 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtf3c1Q8K284 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtf3c1Q8K284 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf3c1Q8K284 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf3c1Q8K284 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf3c1Q8K284 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf3c1Q8K284 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf3c1Q8K284 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf3c1Q8K284 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf3c1Q8K284 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf3c1Q8K284 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf3c1Q8K284 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf3c1Q8K284 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf3c1Q8K284 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf3c1Q8K284 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf3c1Q8K284 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf3c1Q8K284 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf3c1Q8K284 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf3c1Q8K284 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf3c1Q8K284 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf3c1Q8K284 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf3c1Q8K284 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf3c1Q8K284 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf3c1Q8K284 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf3c1Q8K284 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf3c1Q8K284 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf3c1Q8K284 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf3c1Q8K284 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf3c1Q8K284 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf3c1Q8K284 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf3c1Q8K284 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf3c1Q8K284 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf3c1Q8K284 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf3c1Q8K284 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf3c1Q8K284 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf3c1Q8K284 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtf3c1Q8K284 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtf3c1Q8K284 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtf3c1Q8K284 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtf3c1Q8K284 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtf3c1Q8K284 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtf3c1Q8K284 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtf3c1Q8K284 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtf3c1Q8K284 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtf3c1Q8K284 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gtf3c1Q8K284 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gtf3c1Q8K284 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf3c1Q8K284 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf3c1Q8K284 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf3c1Q8K284 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf3c1Q8K284 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf3c1Q8K284 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf3c1Q8K284 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf3c1Q8K284 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf3c1Q8K284 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf3c1Q8K284 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf3c1Q8K284 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf3c1Q8K284 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf3c1Q8K284 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf3c1Q8K284 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf3c1Q8K284 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf3c1Q8K284 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf3c1Q8K284 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf3c1Q8K284 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf3c1Q8K284 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf3c1Q8K284 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf3c1Q8K284 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf3c1Q8K284 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf3c1Q8K284 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf3c1Q8K284 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf3c1Q8K284 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf3c1Q8K284 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf3c1Q8K284 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf3c1Q8K284 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf3c1Q8K284 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf3c1Q8K284 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf3c1Q8K284 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf3c1Q8K284 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf3c1Q8K284 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf3c1Q8K284 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf3c1Q8K284 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf3c1Q8K284 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf3c1Q8K284 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf3c1Q8K284 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf3c1Q8K284 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf3c1Q8K284 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf3c1Q8K284 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf3c1Q8K284 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf3c1Q8K284 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf3c1Q8K284 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf3c1Q8K284 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf3c1Q8K284 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf3c1Q8K284 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf3c1Q8K284 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf3c1Q8K284 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf3c1Q8K284 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms