Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0U3

Tmem17, Transmembrane protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem17Q8K0U3 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem17Q8K0U3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem17Q8K0U3 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem17Q8K0U3 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem17Q8K0U3 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem17Q8K0U3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem17Q8K0U3 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem17Q8K0U3 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem17Q8K0U3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem17Q8K0U3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem17Q8K0U3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem17Q8K0U3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem17Q8K0U3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem17Q8K0U3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem17Q8K0U3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem17Q8K0U3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem17Q8K0U3 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem17Q8K0U3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem17Q8K0U3 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem17Q8K0U3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem17Q8K0U3 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem17Q8K0U3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem17Q8K0U3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem17Q8K0U3 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem17Q8K0U3 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem17Q8K0U3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem17Q8K0U3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem17Q8K0U3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem17Q8K0U3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem17Q8K0U3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem17Q8K0U3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem17Q8K0U3 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem17Q8K0U3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem17Q8K0U3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem17Q8K0U3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem17Q8K0U3 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem17Q8K0U3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem17Q8K0U3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem17Q8K0U3 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem17Q8K0U3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem17Q8K0U3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem17Q8K0U3 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem17Q8K0U3 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem17Q8K0U3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem17Q8K0U3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem17Q8K0U3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem17Q8K0U3 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem17Q8K0U3 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem17Q8K0U3 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem17Q8K0U3 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem17Q8K0U3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem17Q8K0U3 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem17Q8K0U3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem17Q8K0U3 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem17Q8K0U3 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem17Q8K0U3 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem17Q8K0U3 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem17Q8K0U3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem17Q8K0U3 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem17Q8K0U3 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem17Q8K0U3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem17Q8K0U3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem17Q8K0U3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem17Q8K0U3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem17Q8K0U3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem17Q8K0U3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem17Q8K0U3 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem17Q8K0U3 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem17Q8K0U3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem17Q8K0U3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem17Q8K0U3 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem17Q8K0U3 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem17Q8K0U3 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem17Q8K0U3 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem17Q8K0U3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem17Q8K0U3 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem17Q8K0U3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem17Q8K0U3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem17Q8K0U3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem17Q8K0U3 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem17Q8K0U3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem17Q8K0U3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem17Q8K0U3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem17Q8K0U3 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem17Q8K0U3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmem17Q8K0U3 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmem17Q8K0U3 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmem17Q8K0U3 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmem17Q8K0U3 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem17Q8K0U3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem17Q8K0U3 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem17Q8K0U3 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem17Q8K0U3 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem17Q8K0U3 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem17Q8K0U3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem17Q8K0U3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem17Q8K0U3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem17Q8K0U3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem17Q8K0U3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem17Q8K0U3 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms