Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1D8

Iws1, Protein IWS1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Iws1Q8C1D8 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Iws1Q8C1D8 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Iws1Q8C1D8 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Iws1Q8C1D8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Iws1Q8C1D8 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Iws1Q8C1D8 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Iws1Q8C1D8 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Iws1Q8C1D8 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Iws1Q8C1D8 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Iws1Q8C1D8 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Iws1Q8C1D8 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Iws1Q8C1D8 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Iws1Q8C1D8 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Iws1Q8C1D8 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Iws1Q8C1D8 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Iws1Q8C1D8 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Iws1Q8C1D8 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Iws1Q8C1D8 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Iws1Q8C1D8 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Iws1Q8C1D8 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Iws1Q8C1D8 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Iws1Q8C1D8 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Iws1Q8C1D8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Iws1Q8C1D8 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Iws1Q8C1D8 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Iws1Q8C1D8 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Iws1Q8C1D8 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Iws1Q8C1D8 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Iws1Q8C1D8 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Iws1Q8C1D8 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Iws1Q8C1D8 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Iws1Q8C1D8 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Iws1Q8C1D8 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Iws1Q8C1D8 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Iws1Q8C1D8 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Iws1Q8C1D8 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Iws1Q8C1D8 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Iws1Q8C1D8 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Iws1Q8C1D8 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Iws1Q8C1D8 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Iws1Q8C1D8 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Iws1Q8C1D8 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Iws1Q8C1D8 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Iws1Q8C1D8 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Iws1Q8C1D8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Iws1Q8C1D8 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Iws1Q8C1D8 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Iws1Q8C1D8 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Iws1Q8C1D8 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Iws1Q8C1D8 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Iws1Q8C1D8 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Iws1Q8C1D8 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Iws1Q8C1D8 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Iws1Q8C1D8 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Iws1Q8C1D8 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Iws1Q8C1D8 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Iws1Q8C1D8 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Iws1Q8C1D8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Iws1Q8C1D8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Iws1Q8C1D8 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Iws1Q8C1D8 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Iws1Q8C1D8 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Iws1Q8C1D8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Iws1Q8C1D8 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Iws1Q8C1D8 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Iws1Q8C1D8 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Iws1Q8C1D8 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Iws1Q8C1D8 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Iws1Q8C1D8 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Iws1Q8C1D8 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Iws1Q8C1D8 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Iws1Q8C1D8 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Iws1Q8C1D8 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Iws1Q8C1D8 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Iws1Q8C1D8 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Iws1Q8C1D8 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Iws1Q8C1D8 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Iws1Q8C1D8 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Iws1Q8C1D8 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Iws1Q8C1D8 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Iws1Q8C1D8 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Iws1Q8C1D8 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Iws1Q8C1D8 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Iws1Q8C1D8 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Iws1Q8C1D8 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Iws1Q8C1D8 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Iws1Q8C1D8 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Iws1Q8C1D8 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Iws1Q8C1D8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Iws1Q8C1D8 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Iws1Q8C1D8 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Iws1Q8C1D8 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Iws1Q8C1D8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Iws1Q8C1D8 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Iws1Q8C1D8 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Iws1Q8C1D8 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Iws1Q8C1D8 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Iws1Q8C1D8 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Iws1Q8C1D8 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Iws1Q8C1D8 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms