Protein–RNA interactions for Protein: Q8C078

Camkk2, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase kinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Camkk2Q8C078 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Camkk2Q8C078 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Camkk2Q8C078 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Camkk2Q8C078 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Camkk2Q8C078 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Camkk2Q8C078 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Camkk2Q8C078 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Camkk2Q8C078 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Camkk2Q8C078 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Camkk2Q8C078 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Camkk2Q8C078 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Camkk2Q8C078 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Camkk2Q8C078 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Camkk2Q8C078 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Camkk2Q8C078 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Camkk2Q8C078 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Camkk2Q8C078 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Camkk2Q8C078 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Camkk2Q8C078 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Camkk2Q8C078 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Camkk2Q8C078 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Camkk2Q8C078 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Camkk2Q8C078 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Camkk2Q8C078 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Camkk2Q8C078 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Camkk2Q8C078 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Camkk2Q8C078 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Camkk2Q8C078 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Camkk2Q8C078 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Camkk2Q8C078 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Camkk2Q8C078 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Camkk2Q8C078 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Camkk2Q8C078 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Camkk2Q8C078 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Camkk2Q8C078 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Camkk2Q8C078 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Camkk2Q8C078 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Camkk2Q8C078 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Camkk2Q8C078 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Camkk2Q8C078 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Camkk2Q8C078 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Camkk2Q8C078 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Camkk2Q8C078 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Camkk2Q8C078 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Camkk2Q8C078 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Camkk2Q8C078 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Camkk2Q8C078 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Camkk2Q8C078 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Camkk2Q8C078 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Camkk2Q8C078 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Camkk2Q8C078 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Camkk2Q8C078 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Camkk2Q8C078 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Camkk2Q8C078 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Camkk2Q8C078 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Camkk2Q8C078 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Camkk2Q8C078 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Camkk2Q8C078 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Camkk2Q8C078 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Camkk2Q8C078 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Camkk2Q8C078 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Camkk2Q8C078 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Camkk2Q8C078 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Camkk2Q8C078 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Camkk2Q8C078 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Camkk2Q8C078 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Camkk2Q8C078 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Camkk2Q8C078 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Camkk2Q8C078 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Camkk2Q8C078 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Camkk2Q8C078 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Camkk2Q8C078 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Camkk2Q8C078 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Camkk2Q8C078 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Camkk2Q8C078 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Camkk2Q8C078 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Camkk2Q8C078 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Camkk2Q8C078 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Camkk2Q8C078 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Camkk2Q8C078 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Camkk2Q8C078 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Camkk2Q8C078 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Camkk2Q8C078 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Camkk2Q8C078 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Camkk2Q8C078 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Camkk2Q8C078 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Camkk2Q8C078 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Camkk2Q8C078 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Camkk2Q8C078 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Camkk2Q8C078 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Camkk2Q8C078 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Camkk2Q8C078 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Camkk2Q8C078 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Camkk2Q8C078 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Camkk2Q8C078 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Camkk2Q8C078 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Camkk2Q8C078 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Camkk2Q8C078 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Camkk2Q8C078 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Camkk2Q8C078 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms