Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXL7

Arfrp1, ADP-ribosylation factor-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfrp1Q8BXL7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arfrp1Q8BXL7 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arfrp1Q8BXL7 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arfrp1Q8BXL7 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arfrp1Q8BXL7 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arfrp1Q8BXL7 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arfrp1Q8BXL7 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arfrp1Q8BXL7 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arfrp1Q8BXL7 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arfrp1Q8BXL7 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arfrp1Q8BXL7 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arfrp1Q8BXL7 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arfrp1Q8BXL7 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Arfrp1Q8BXL7 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arfrp1Q8BXL7 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Arfrp1Q8BXL7 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arfrp1Q8BXL7 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arfrp1Q8BXL7 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arfrp1Q8BXL7 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arfrp1Q8BXL7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arfrp1Q8BXL7 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arfrp1Q8BXL7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Arfrp1Q8BXL7 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Arfrp1Q8BXL7 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arfrp1Q8BXL7 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arfrp1Q8BXL7 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Arfrp1Q8BXL7 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arfrp1Q8BXL7 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arfrp1Q8BXL7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arfrp1Q8BXL7 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arfrp1Q8BXL7 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arfrp1Q8BXL7 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arfrp1Q8BXL7 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arfrp1Q8BXL7 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arfrp1Q8BXL7 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arfrp1Q8BXL7 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arfrp1Q8BXL7 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arfrp1Q8BXL7 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arfrp1Q8BXL7 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Arfrp1Q8BXL7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arfrp1Q8BXL7 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arfrp1Q8BXL7 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arfrp1Q8BXL7 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arfrp1Q8BXL7 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arfrp1Q8BXL7 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arfrp1Q8BXL7 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arfrp1Q8BXL7 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arfrp1Q8BXL7 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arfrp1Q8BXL7 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arfrp1Q8BXL7 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arfrp1Q8BXL7 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arfrp1Q8BXL7 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arfrp1Q8BXL7 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arfrp1Q8BXL7 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arfrp1Q8BXL7 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arfrp1Q8BXL7 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arfrp1Q8BXL7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arfrp1Q8BXL7 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arfrp1Q8BXL7 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arfrp1Q8BXL7 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arfrp1Q8BXL7 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arfrp1Q8BXL7 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arfrp1Q8BXL7 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arfrp1Q8BXL7 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arfrp1Q8BXL7 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arfrp1Q8BXL7 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arfrp1Q8BXL7 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arfrp1Q8BXL7 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arfrp1Q8BXL7 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arfrp1Q8BXL7 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arfrp1Q8BXL7 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arfrp1Q8BXL7 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arfrp1Q8BXL7 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arfrp1Q8BXL7 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arfrp1Q8BXL7 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arfrp1Q8BXL7 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arfrp1Q8BXL7 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arfrp1Q8BXL7 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arfrp1Q8BXL7 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arfrp1Q8BXL7 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arfrp1Q8BXL7 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arfrp1Q8BXL7 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Arfrp1Q8BXL7 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arfrp1Q8BXL7 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arfrp1Q8BXL7 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arfrp1Q8BXL7 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arfrp1Q8BXL7 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arfrp1Q8BXL7 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Arfrp1Q8BXL7 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arfrp1Q8BXL7 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arfrp1Q8BXL7 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arfrp1Q8BXL7 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arfrp1Q8BXL7 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arfrp1Q8BXL7 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arfrp1Q8BXL7 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arfrp1Q8BXL7 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arfrp1Q8BXL7 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arfrp1Q8BXL7 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arfrp1Q8BXL7 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arfrp1Q8BXL7 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms