Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQ08

5730596B20Rik, RIKEN cDNA 5730596B20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5730596B20RikQ8BQ08 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
5730596B20RikQ8BQ08 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
5730596B20RikQ8BQ08 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
5730596B20RikQ8BQ08 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
5730596B20RikQ8BQ08 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
5730596B20RikQ8BQ08 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
5730596B20RikQ8BQ08 Cnot2-201ENSMUST00000020374 1059 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
5730596B20RikQ8BQ08 Gm44548-201ENSMUST00000208929 192 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
5730596B20RikQ8BQ08 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
5730596B20RikQ8BQ08 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
5730596B20RikQ8BQ08 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
5730596B20RikQ8BQ08 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
5730596B20RikQ8BQ08 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
5730596B20RikQ8BQ08 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
5730596B20RikQ8BQ08 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
5730596B20RikQ8BQ08 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
5730596B20RikQ8BQ08 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
5730596B20RikQ8BQ08 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
5730596B20RikQ8BQ08 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
5730596B20RikQ8BQ08 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
5730596B20RikQ8BQ08 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
5730596B20RikQ8BQ08 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
5730596B20RikQ8BQ08 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
5730596B20RikQ8BQ08 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
5730596B20RikQ8BQ08 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
5730596B20RikQ8BQ08 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
5730596B20RikQ8BQ08 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
5730596B20RikQ8BQ08 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
5730596B20RikQ8BQ08 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
5730596B20RikQ8BQ08 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
5730596B20RikQ8BQ08 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
5730596B20RikQ8BQ08 Ccdc54-201ENSMUST00000062439 1296 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
5730596B20RikQ8BQ08 Pbld1-202ENSMUST00000178684 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
5730596B20RikQ8BQ08 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
5730596B20RikQ8BQ08 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
5730596B20RikQ8BQ08 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
5730596B20RikQ8BQ08 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
5730596B20RikQ8BQ08 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
5730596B20RikQ8BQ08 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
5730596B20RikQ8BQ08 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
5730596B20RikQ8BQ08 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Gm11008-201ENSMUST00000109032 622 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 CT025552.1-201ENSMUST00000224561 521 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 AC154252.1-201ENSMUST00000226041 473 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Gm14435-201ENSMUST00000108995 643 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 1700065O20Rik-201ENSMUST00000186872 710 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Gm29288-201ENSMUST00000191582 901 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms