Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLH7

Hirip3, HIRA-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hirip3Q8BLH7 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hirip3Q8BLH7 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hirip3Q8BLH7 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hirip3Q8BLH7 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hirip3Q8BLH7 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hirip3Q8BLH7 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hirip3Q8BLH7 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hirip3Q8BLH7 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hirip3Q8BLH7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hirip3Q8BLH7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hirip3Q8BLH7 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hirip3Q8BLH7 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Hirip3Q8BLH7 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hirip3Q8BLH7 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hirip3Q8BLH7 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hirip3Q8BLH7 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hirip3Q8BLH7 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Hirip3Q8BLH7 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hirip3Q8BLH7 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hirip3Q8BLH7 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Hirip3Q8BLH7 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Hirip3Q8BLH7 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hirip3Q8BLH7 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hirip3Q8BLH7 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hirip3Q8BLH7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hirip3Q8BLH7 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Hirip3Q8BLH7 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hirip3Q8BLH7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hirip3Q8BLH7 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hirip3Q8BLH7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hirip3Q8BLH7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hirip3Q8BLH7 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hirip3Q8BLH7 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hirip3Q8BLH7 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hirip3Q8BLH7 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Hirip3Q8BLH7 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hirip3Q8BLH7 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hirip3Q8BLH7 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hirip3Q8BLH7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hirip3Q8BLH7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hirip3Q8BLH7 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hirip3Q8BLH7 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hirip3Q8BLH7 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hirip3Q8BLH7 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hirip3Q8BLH7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hirip3Q8BLH7 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hirip3Q8BLH7 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hirip3Q8BLH7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Hirip3Q8BLH7 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hirip3Q8BLH7 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hirip3Q8BLH7 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hirip3Q8BLH7 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hirip3Q8BLH7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Hirip3Q8BLH7 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Hirip3Q8BLH7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hirip3Q8BLH7 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Hirip3Q8BLH7 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hirip3Q8BLH7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hirip3Q8BLH7 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hirip3Q8BLH7 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hirip3Q8BLH7 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hirip3Q8BLH7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hirip3Q8BLH7 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hirip3Q8BLH7 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Hirip3Q8BLH7 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hirip3Q8BLH7 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hirip3Q8BLH7 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hirip3Q8BLH7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hirip3Q8BLH7 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hirip3Q8BLH7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hirip3Q8BLH7 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hirip3Q8BLH7 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hirip3Q8BLH7 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hirip3Q8BLH7 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hirip3Q8BLH7 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hirip3Q8BLH7 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hirip3Q8BLH7 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hirip3Q8BLH7 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hirip3Q8BLH7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hirip3Q8BLH7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hirip3Q8BLH7 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hirip3Q8BLH7 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Hirip3Q8BLH7 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hirip3Q8BLH7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hirip3Q8BLH7 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hirip3Q8BLH7 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hirip3Q8BLH7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hirip3Q8BLH7 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hirip3Q8BLH7 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hirip3Q8BLH7 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hirip3Q8BLH7 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hirip3Q8BLH7 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Hirip3Q8BLH7 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Hirip3Q8BLH7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hirip3Q8BLH7 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hirip3Q8BLH7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hirip3Q8BLH7 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Hirip3Q8BLH7 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hirip3Q8BLH7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hirip3Q8BLH7 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms