Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKD6

Rnf144b, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144B, mousemouse

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Length 301 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144bQ8BKD6 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Rnf144bQ8BKD6 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Rnf144bQ8BKD6 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf144bQ8BKD6 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf144bQ8BKD6 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Rnf144bQ8BKD6 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf144bQ8BKD6 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf144bQ8BKD6 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf144bQ8BKD6 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Rnf144bQ8BKD6 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf144bQ8BKD6 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf144bQ8BKD6 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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