Protein–RNA interactions for Protein: Q8BII3

D130040H23Rik, RIKEN cDNA D130040H23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130040H23RikQ8BII3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
D130040H23RikQ8BII3 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
D130040H23RikQ8BII3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
D130040H23RikQ8BII3 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
D130040H23RikQ8BII3 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
D130040H23RikQ8BII3 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
D130040H23RikQ8BII3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
D130040H23RikQ8BII3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
D130040H23RikQ8BII3 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
D130040H23RikQ8BII3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
D130040H23RikQ8BII3 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
D130040H23RikQ8BII3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
D130040H23RikQ8BII3 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
D130040H23RikQ8BII3 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
D130040H23RikQ8BII3 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
D130040H23RikQ8BII3 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
D130040H23RikQ8BII3 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
D130040H23RikQ8BII3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
D130040H23RikQ8BII3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
D130040H23RikQ8BII3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
D130040H23RikQ8BII3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
D130040H23RikQ8BII3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
D130040H23RikQ8BII3 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
D130040H23RikQ8BII3 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
D130040H23RikQ8BII3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
D130040H23RikQ8BII3 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
D130040H23RikQ8BII3 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
D130040H23RikQ8BII3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
D130040H23RikQ8BII3 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
D130040H23RikQ8BII3 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
D130040H23RikQ8BII3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
D130040H23RikQ8BII3 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
D130040H23RikQ8BII3 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
D130040H23RikQ8BII3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
D130040H23RikQ8BII3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
D130040H23RikQ8BII3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
D130040H23RikQ8BII3 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
D130040H23RikQ8BII3 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
D130040H23RikQ8BII3 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
D130040H23RikQ8BII3 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
D130040H23RikQ8BII3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
D130040H23RikQ8BII3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
D130040H23RikQ8BII3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
D130040H23RikQ8BII3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
D130040H23RikQ8BII3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
D130040H23RikQ8BII3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
D130040H23RikQ8BII3 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
D130040H23RikQ8BII3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
D130040H23RikQ8BII3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
D130040H23RikQ8BII3 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
D130040H23RikQ8BII3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
D130040H23RikQ8BII3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
D130040H23RikQ8BII3 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
D130040H23RikQ8BII3 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
D130040H23RikQ8BII3 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
D130040H23RikQ8BII3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
D130040H23RikQ8BII3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
D130040H23RikQ8BII3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
D130040H23RikQ8BII3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
D130040H23RikQ8BII3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
D130040H23RikQ8BII3 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
D130040H23RikQ8BII3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
D130040H23RikQ8BII3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
D130040H23RikQ8BII3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
D130040H23RikQ8BII3 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
D130040H23RikQ8BII3 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
D130040H23RikQ8BII3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
D130040H23RikQ8BII3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
D130040H23RikQ8BII3 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
D130040H23RikQ8BII3 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
D130040H23RikQ8BII3 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
D130040H23RikQ8BII3 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
D130040H23RikQ8BII3 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
D130040H23RikQ8BII3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
D130040H23RikQ8BII3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
D130040H23RikQ8BII3 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
D130040H23RikQ8BII3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
D130040H23RikQ8BII3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
D130040H23RikQ8BII3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
D130040H23RikQ8BII3 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
D130040H23RikQ8BII3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
D130040H23RikQ8BII3 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
D130040H23RikQ8BII3 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
D130040H23RikQ8BII3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
D130040H23RikQ8BII3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
D130040H23RikQ8BII3 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
D130040H23RikQ8BII3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
D130040H23RikQ8BII3 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
D130040H23RikQ8BII3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
D130040H23RikQ8BII3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
D130040H23RikQ8BII3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
D130040H23RikQ8BII3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
D130040H23RikQ8BII3 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
D130040H23RikQ8BII3 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
D130040H23RikQ8BII3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
D130040H23RikQ8BII3 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
D130040H23RikQ8BII3 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
D130040H23RikQ8BII3 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
D130040H23RikQ8BII3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
D130040H23RikQ8BII3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms