Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGW3

Bhlhe23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe23Q8BGW3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bhlhe23Q8BGW3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bhlhe23Q8BGW3 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bhlhe23Q8BGW3 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bhlhe23Q8BGW3 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bhlhe23Q8BGW3 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bhlhe23Q8BGW3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bhlhe23Q8BGW3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bhlhe23Q8BGW3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bhlhe23Q8BGW3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bhlhe23Q8BGW3 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bhlhe23Q8BGW3 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bhlhe23Q8BGW3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bhlhe23Q8BGW3 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bhlhe23Q8BGW3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Bhlhe23Q8BGW3 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bhlhe23Q8BGW3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bhlhe23Q8BGW3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bhlhe23Q8BGW3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bhlhe23Q8BGW3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bhlhe23Q8BGW3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bhlhe23Q8BGW3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bhlhe23Q8BGW3 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bhlhe23Q8BGW3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bhlhe23Q8BGW3 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bhlhe23Q8BGW3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bhlhe23Q8BGW3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bhlhe23Q8BGW3 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bhlhe23Q8BGW3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bhlhe23Q8BGW3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bhlhe23Q8BGW3 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bhlhe23Q8BGW3 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bhlhe23Q8BGW3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bhlhe23Q8BGW3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bhlhe23Q8BGW3 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bhlhe23Q8BGW3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bhlhe23Q8BGW3 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bhlhe23Q8BGW3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bhlhe23Q8BGW3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bhlhe23Q8BGW3 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bhlhe23Q8BGW3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bhlhe23Q8BGW3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bhlhe23Q8BGW3 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Bhlhe23Q8BGW3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bhlhe23Q8BGW3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bhlhe23Q8BGW3 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bhlhe23Q8BGW3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bhlhe23Q8BGW3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bhlhe23Q8BGW3 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bhlhe23Q8BGW3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bhlhe23Q8BGW3 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bhlhe23Q8BGW3 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bhlhe23Q8BGW3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bhlhe23Q8BGW3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bhlhe23Q8BGW3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Bhlhe23Q8BGW3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bhlhe23Q8BGW3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bhlhe23Q8BGW3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bhlhe23Q8BGW3 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bhlhe23Q8BGW3 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bhlhe23Q8BGW3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bhlhe23Q8BGW3 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bhlhe23Q8BGW3 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bhlhe23Q8BGW3 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Bhlhe23Q8BGW3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Bhlhe23Q8BGW3 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Bhlhe23Q8BGW3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Bhlhe23Q8BGW3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Bhlhe23Q8BGW3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bhlhe23Q8BGW3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bhlhe23Q8BGW3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bhlhe23Q8BGW3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bhlhe23Q8BGW3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bhlhe23Q8BGW3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Bhlhe23Q8BGW3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bhlhe23Q8BGW3 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bhlhe23Q8BGW3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bhlhe23Q8BGW3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bhlhe23Q8BGW3 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bhlhe23Q8BGW3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bhlhe23Q8BGW3 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bhlhe23Q8BGW3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bhlhe23Q8BGW3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bhlhe23Q8BGW3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bhlhe23Q8BGW3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bhlhe23Q8BGW3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bhlhe23Q8BGW3 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bhlhe23Q8BGW3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bhlhe23Q8BGW3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bhlhe23Q8BGW3 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bhlhe23Q8BGW3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bhlhe23Q8BGW3 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bhlhe23Q8BGW3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bhlhe23Q8BGW3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bhlhe23Q8BGW3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bhlhe23Q8BGW3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Bhlhe23Q8BGW3 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bhlhe23Q8BGW3 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bhlhe23Q8BGW3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bhlhe23Q8BGW3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms