Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFY9

Tnpo1, Transportin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnpo1Q8BFY9 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnpo1Q8BFY9 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnpo1Q8BFY9 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnpo1Q8BFY9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnpo1Q8BFY9 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnpo1Q8BFY9 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnpo1Q8BFY9 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnpo1Q8BFY9 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnpo1Q8BFY9 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnpo1Q8BFY9 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnpo1Q8BFY9 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnpo1Q8BFY9 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnpo1Q8BFY9 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnpo1Q8BFY9 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnpo1Q8BFY9 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnpo1Q8BFY9 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnpo1Q8BFY9 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnpo1Q8BFY9 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnpo1Q8BFY9 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnpo1Q8BFY9 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnpo1Q8BFY9 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnpo1Q8BFY9 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnpo1Q8BFY9 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnpo1Q8BFY9 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnpo1Q8BFY9 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnpo1Q8BFY9 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnpo1Q8BFY9 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnpo1Q8BFY9 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnpo1Q8BFY9 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnpo1Q8BFY9 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnpo1Q8BFY9 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnpo1Q8BFY9 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnpo1Q8BFY9 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnpo1Q8BFY9 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnpo1Q8BFY9 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnpo1Q8BFY9 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tnpo1Q8BFY9 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tnpo1Q8BFY9 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tnpo1Q8BFY9 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tnpo1Q8BFY9 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnpo1Q8BFY9 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnpo1Q8BFY9 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnpo1Q8BFY9 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnpo1Q8BFY9 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnpo1Q8BFY9 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnpo1Q8BFY9 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnpo1Q8BFY9 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnpo1Q8BFY9 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnpo1Q8BFY9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnpo1Q8BFY9 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnpo1Q8BFY9 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnpo1Q8BFY9 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnpo1Q8BFY9 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnpo1Q8BFY9 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnpo1Q8BFY9 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnpo1Q8BFY9 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnpo1Q8BFY9 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnpo1Q8BFY9 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnpo1Q8BFY9 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnpo1Q8BFY9 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnpo1Q8BFY9 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnpo1Q8BFY9 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnpo1Q8BFY9 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnpo1Q8BFY9 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnpo1Q8BFY9 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnpo1Q8BFY9 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnpo1Q8BFY9 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnpo1Q8BFY9 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnpo1Q8BFY9 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnpo1Q8BFY9 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnpo1Q8BFY9 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnpo1Q8BFY9 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnpo1Q8BFY9 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnpo1Q8BFY9 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnpo1Q8BFY9 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnpo1Q8BFY9 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnpo1Q8BFY9 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnpo1Q8BFY9 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnpo1Q8BFY9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnpo1Q8BFY9 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnpo1Q8BFY9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnpo1Q8BFY9 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnpo1Q8BFY9 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnpo1Q8BFY9 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnpo1Q8BFY9 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnpo1Q8BFY9 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnpo1Q8BFY9 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnpo1Q8BFY9 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnpo1Q8BFY9 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnpo1Q8BFY9 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnpo1Q8BFY9 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnpo1Q8BFY9 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnpo1Q8BFY9 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnpo1Q8BFY9 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnpo1Q8BFY9 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnpo1Q8BFY9 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnpo1Q8BFY9 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnpo1Q8BFY9 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnpo1Q8BFY9 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnpo1Q8BFY9 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms