Protein–RNA interactions for Protein: Q80UJ1

Slc22a20, Solute carrier family 22 member 20, mousemouse

Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc22a20Q80UJ1 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc22a20Q80UJ1 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc22a20Q80UJ1 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc22a20Q80UJ1 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc22a20Q80UJ1 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc22a20Q80UJ1 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc22a20Q80UJ1 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc22a20Q80UJ1 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc22a20Q80UJ1 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc22a20Q80UJ1 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc22a20Q80UJ1 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc22a20Q80UJ1 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc22a20Q80UJ1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc22a20Q80UJ1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc22a20Q80UJ1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc22a20Q80UJ1 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc22a20Q80UJ1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc22a20Q80UJ1 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc22a20Q80UJ1 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc22a20Q80UJ1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc22a20Q80UJ1 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc22a20Q80UJ1 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc22a20Q80UJ1 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc22a20Q80UJ1 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc22a20Q80UJ1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc22a20Q80UJ1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc22a20Q80UJ1 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc22a20Q80UJ1 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc22a20Q80UJ1 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc22a20Q80UJ1 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc22a20Q80UJ1 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc22a20Q80UJ1 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc22a20Q80UJ1 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc22a20Q80UJ1 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc22a20Q80UJ1 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc22a20Q80UJ1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc22a20Q80UJ1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc22a20Q80UJ1 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc22a20Q80UJ1 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc22a20Q80UJ1 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc22a20Q80UJ1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc22a20Q80UJ1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc22a20Q80UJ1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc22a20Q80UJ1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc22a20Q80UJ1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc22a20Q80UJ1 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc22a20Q80UJ1 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc22a20Q80UJ1 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc22a20Q80UJ1 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc22a20Q80UJ1 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc22a20Q80UJ1 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc22a20Q80UJ1 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc22a20Q80UJ1 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc22a20Q80UJ1 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc22a20Q80UJ1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc22a20Q80UJ1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc22a20Q80UJ1 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc22a20Q80UJ1 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc22a20Q80UJ1 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc22a20Q80UJ1 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc22a20Q80UJ1 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc22a20Q80UJ1 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc22a20Q80UJ1 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc22a20Q80UJ1 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc22a20Q80UJ1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc22a20Q80UJ1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc22a20Q80UJ1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc22a20Q80UJ1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc22a20Q80UJ1 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc22a20Q80UJ1 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc22a20Q80UJ1 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc22a20Q80UJ1 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc22a20Q80UJ1 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc22a20Q80UJ1 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc22a20Q80UJ1 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc22a20Q80UJ1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc22a20Q80UJ1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc22a20Q80UJ1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc22a20Q80UJ1 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc22a20Q80UJ1 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc22a20Q80UJ1 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc22a20Q80UJ1 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc22a20Q80UJ1 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc22a20Q80UJ1 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc22a20Q80UJ1 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc22a20Q80UJ1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc22a20Q80UJ1 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc22a20Q80UJ1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc22a20Q80UJ1 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc22a20Q80UJ1 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc22a20Q80UJ1 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc22a20Q80UJ1 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc22a20Q80UJ1 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc22a20Q80UJ1 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc22a20Q80UJ1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc22a20Q80UJ1 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc22a20Q80UJ1 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc22a20Q80UJ1 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc22a20Q80UJ1 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc22a20Q80UJ1 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms