Protein–RNA interactions for Protein: Q80U49

Cep170b, Centrosomal protein of 170 kDa protein B, mousemouse

Predictions only

Length 1,574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep170bQ80U49 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cep170bQ80U49 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cep170bQ80U49 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cep170bQ80U49 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Cep170bQ80U49 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cep170bQ80U49 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cep170bQ80U49 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cep170bQ80U49 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cep170bQ80U49 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cep170bQ80U49 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cep170bQ80U49 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cep170bQ80U49 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cep170bQ80U49 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cep170bQ80U49 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cep170bQ80U49 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cep170bQ80U49 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cep170bQ80U49 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cep170bQ80U49 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cep170bQ80U49 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Cep170bQ80U49 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cep170bQ80U49 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cep170bQ80U49 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Cep170bQ80U49 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cep170bQ80U49 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Cep170bQ80U49 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cep170bQ80U49 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cep170bQ80U49 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cep170bQ80U49 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cep170bQ80U49 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cep170bQ80U49 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cep170bQ80U49 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cep170bQ80U49 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cep170bQ80U49 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cep170bQ80U49 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cep170bQ80U49 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cep170bQ80U49 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cep170bQ80U49 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cep170bQ80U49 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cep170bQ80U49 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cep170bQ80U49 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cep170bQ80U49 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cep170bQ80U49 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cep170bQ80U49 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cep170bQ80U49 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cep170bQ80U49 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cep170bQ80U49 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cep170bQ80U49 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Cep170bQ80U49 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cep170bQ80U49 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Cep170bQ80U49 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cep170bQ80U49 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cep170bQ80U49 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cep170bQ80U49 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cep170bQ80U49 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Cep170bQ80U49 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
Cep170bQ80U49 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cep170bQ80U49 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cep170bQ80U49 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cep170bQ80U49 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Cep170bQ80U49 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cep170bQ80U49 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cep170bQ80U49 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cep170bQ80U49 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cep170bQ80U49 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cep170bQ80U49 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cep170bQ80U49 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cep170bQ80U49 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cep170bQ80U49 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Cep170bQ80U49 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cep170bQ80U49 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Cep170bQ80U49 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cep170bQ80U49 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cep170bQ80U49 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cep170bQ80U49 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cep170bQ80U49 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cep170bQ80U49 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cep170bQ80U49 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Cep170bQ80U49 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cep170bQ80U49 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cep170bQ80U49 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cep170bQ80U49 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cep170bQ80U49 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cep170bQ80U49 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cep170bQ80U49 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cep170bQ80U49 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cep170bQ80U49 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cep170bQ80U49 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Cep170bQ80U49 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cep170bQ80U49 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cep170bQ80U49 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cep170bQ80U49 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cep170bQ80U49 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cep170bQ80U49 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cep170bQ80U49 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cep170bQ80U49 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cep170bQ80U49 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cep170bQ80U49 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cep170bQ80U49 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cep170bQ80U49 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cep170bQ80U49 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms