Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
NischQ80TM9 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
NischQ80TM9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
NischQ80TM9 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC39.9■■■■□ 3.98
NischQ80TM9 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.89■■■■□ 3.98
NischQ80TM9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.89■■■■□ 3.98
NischQ80TM9 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
NischQ80TM9 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
NischQ80TM9 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.89■■■■□ 3.98
NischQ80TM9 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.89■■■■□ 3.98
NischQ80TM9 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
NischQ80TM9 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.98
NischQ80TM9 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC39.88■■■■□ 3.97
NischQ80TM9 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC39.88■■■■□ 3.97
NischQ80TM9 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
NischQ80TM9 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
NischQ80TM9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
NischQ80TM9 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC39.87■■■■□ 3.97
NischQ80TM9 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
NischQ80TM9 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
NischQ80TM9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
NischQ80TM9 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
NischQ80TM9 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC39.86■■■■□ 3.97
NischQ80TM9 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.86■■■■□ 3.97
NischQ80TM9 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
NischQ80TM9 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC39.86■■■■□ 3.97
NischQ80TM9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC39.86■■■■□ 3.97
NischQ80TM9 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC39.85■■■■□ 3.97
NischQ80TM9 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
NischQ80TM9 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
NischQ80TM9 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
NischQ80TM9 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC39.85■■■■□ 3.97
NischQ80TM9 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
NischQ80TM9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
NischQ80TM9 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
NischQ80TM9 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
NischQ80TM9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC39.84■■■■□ 3.97
NischQ80TM9 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
NischQ80TM9 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
NischQ80TM9 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
NischQ80TM9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
NischQ80TM9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
NischQ80TM9 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC39.83■■■■□ 3.97
NischQ80TM9 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
NischQ80TM9 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
NischQ80TM9 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
NischQ80TM9 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
NischQ80TM9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
NischQ80TM9 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.97
NischQ80TM9 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC39.82■■■■□ 3.97
NischQ80TM9 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.97
NischQ80TM9 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.82■■■■□ 3.96
NischQ80TM9 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
NischQ80TM9 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
NischQ80TM9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC39.81■■■■□ 3.96
NischQ80TM9 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
NischQ80TM9 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
NischQ80TM9 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC39.81■■■■□ 3.96
NischQ80TM9 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC39.8■■■■□ 3.96
NischQ80TM9 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC39.8■■■■□ 3.96
NischQ80TM9 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
NischQ80TM9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC39.8■■■■□ 3.96
NischQ80TM9 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.8■■■■□ 3.96
NischQ80TM9 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
NischQ80TM9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
NischQ80TM9 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC39.79■■■■□ 3.96
NischQ80TM9 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC39.79■■■■□ 3.96
NischQ80TM9 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC39.79■■■■□ 3.96
NischQ80TM9 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
NischQ80TM9 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC39.78■■■■□ 3.96
NischQ80TM9 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
NischQ80TM9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
NischQ80TM9 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
NischQ80TM9 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
NischQ80TM9 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
NischQ80TM9 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.95
NischQ80TM9 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.95
NischQ80TM9 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
NischQ80TM9 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
NischQ80TM9 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
NischQ80TM9 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
NischQ80TM9 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
NischQ80TM9 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
NischQ80TM9 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
NischQ80TM9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
NischQ80TM9 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.73■■■■□ 3.95
NischQ80TM9 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC39.73■■■■□ 3.95
NischQ80TM9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
NischQ80TM9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
NischQ80TM9 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
NischQ80TM9 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
NischQ80TM9 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC39.72■■■■□ 3.95
NischQ80TM9 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
NischQ80TM9 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
NischQ80TM9 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC39.72■■■■□ 3.95
NischQ80TM9 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
NischQ80TM9 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
NischQ80TM9 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC39.71■■■■□ 3.95
NischQ80TM9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
NischQ80TM9 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms