Protein–RNA interactions for Protein: Q7TST5

Lamp3, Lysosome-associated membrane glycoprotein 3, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp3Q7TST5 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lamp3Q7TST5 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lamp3Q7TST5 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lamp3Q7TST5 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lamp3Q7TST5 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lamp3Q7TST5 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lamp3Q7TST5 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lamp3Q7TST5 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lamp3Q7TST5 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lamp3Q7TST5 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lamp3Q7TST5 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lamp3Q7TST5 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lamp3Q7TST5 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lamp3Q7TST5 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lamp3Q7TST5 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Lamp3Q7TST5 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lamp3Q7TST5 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lamp3Q7TST5 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Lamp3Q7TST5 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Lamp3Q7TST5 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lamp3Q7TST5 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lamp3Q7TST5 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lamp3Q7TST5 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lamp3Q7TST5 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lamp3Q7TST5 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lamp3Q7TST5 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lamp3Q7TST5 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lamp3Q7TST5 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Lamp3Q7TST5 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Lamp3Q7TST5 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lamp3Q7TST5 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lamp3Q7TST5 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lamp3Q7TST5 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lamp3Q7TST5 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lamp3Q7TST5 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lamp3Q7TST5 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lamp3Q7TST5 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lamp3Q7TST5 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lamp3Q7TST5 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lamp3Q7TST5 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lamp3Q7TST5 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lamp3Q7TST5 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lamp3Q7TST5 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lamp3Q7TST5 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lamp3Q7TST5 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lamp3Q7TST5 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lamp3Q7TST5 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lamp3Q7TST5 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lamp3Q7TST5 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lamp3Q7TST5 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lamp3Q7TST5 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lamp3Q7TST5 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lamp3Q7TST5 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lamp3Q7TST5 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lamp3Q7TST5 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Lamp3Q7TST5 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lamp3Q7TST5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lamp3Q7TST5 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lamp3Q7TST5 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lamp3Q7TST5 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lamp3Q7TST5 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lamp3Q7TST5 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lamp3Q7TST5 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lamp3Q7TST5 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lamp3Q7TST5 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lamp3Q7TST5 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lamp3Q7TST5 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lamp3Q7TST5 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lamp3Q7TST5 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lamp3Q7TST5 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lamp3Q7TST5 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lamp3Q7TST5 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lamp3Q7TST5 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lamp3Q7TST5 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lamp3Q7TST5 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lamp3Q7TST5 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lamp3Q7TST5 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Lamp3Q7TST5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lamp3Q7TST5 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lamp3Q7TST5 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Lamp3Q7TST5 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lamp3Q7TST5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lamp3Q7TST5 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lamp3Q7TST5 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lamp3Q7TST5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lamp3Q7TST5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lamp3Q7TST5 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lamp3Q7TST5 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Lamp3Q7TST5 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lamp3Q7TST5 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lamp3Q7TST5 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lamp3Q7TST5 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lamp3Q7TST5 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lamp3Q7TST5 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lamp3Q7TST5 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lamp3Q7TST5 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lamp3Q7TST5 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lamp3Q7TST5 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lamp3Q7TST5 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lamp3Q7TST5 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms