Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ClmQ7TSN2 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ClmQ7TSN2 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ClmQ7TSN2 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ClmQ7TSN2 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ClmQ7TSN2 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ClmQ7TSN2 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ClmQ7TSN2 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ClmQ7TSN2 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ClmQ7TSN2 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ClmQ7TSN2 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ClmQ7TSN2 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ClmQ7TSN2 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ClmQ7TSN2 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ClmQ7TSN2 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ClmQ7TSN2 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ClmQ7TSN2 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ClmQ7TSN2 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ClmQ7TSN2 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ClmQ7TSN2 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ClmQ7TSN2 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ClmQ7TSN2 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ClmQ7TSN2 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ClmQ7TSN2 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ClmQ7TSN2 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ClmQ7TSN2 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ClmQ7TSN2 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ClmQ7TSN2 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ClmQ7TSN2 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ClmQ7TSN2 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ClmQ7TSN2 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ClmQ7TSN2 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ClmQ7TSN2 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ClmQ7TSN2 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ClmQ7TSN2 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ClmQ7TSN2 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ClmQ7TSN2 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ClmQ7TSN2 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ClmQ7TSN2 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ClmQ7TSN2 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ClmQ7TSN2 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ClmQ7TSN2 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ClmQ7TSN2 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ClmQ7TSN2 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ClmQ7TSN2 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ClmQ7TSN2 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ClmQ7TSN2 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ClmQ7TSN2 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ClmQ7TSN2 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ClmQ7TSN2 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ClmQ7TSN2 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ClmQ7TSN2 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ClmQ7TSN2 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ClmQ7TSN2 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ClmQ7TSN2 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ClmQ7TSN2 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ClmQ7TSN2 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ClmQ7TSN2 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ClmQ7TSN2 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ClmQ7TSN2 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ClmQ7TSN2 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ClmQ7TSN2 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ClmQ7TSN2 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ClmQ7TSN2 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ClmQ7TSN2 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ClmQ7TSN2 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ClmQ7TSN2 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ClmQ7TSN2 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ClmQ7TSN2 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ClmQ7TSN2 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ClmQ7TSN2 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ClmQ7TSN2 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ClmQ7TSN2 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ClmQ7TSN2 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ClmQ7TSN2 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ClmQ7TSN2 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ClmQ7TSN2 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ClmQ7TSN2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ClmQ7TSN2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ClmQ7TSN2 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ClmQ7TSN2 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ClmQ7TSN2 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ClmQ7TSN2 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ClmQ7TSN2 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ClmQ7TSN2 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ClmQ7TSN2 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ClmQ7TSN2 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ClmQ7TSN2 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ClmQ7TSN2 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ClmQ7TSN2 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ClmQ7TSN2 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ClmQ7TSN2 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ClmQ7TSN2 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ClmQ7TSN2 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ClmQ7TSN2 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ClmQ7TSN2 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ClmQ7TSN2 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ClmQ7TSN2 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ClmQ7TSN2 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ClmQ7TSN2 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms