Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSK3

Pcdh8, Protocadherin-8, mousemouse

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdh8Q7TSK3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pcdh8Q7TSK3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pcdh8Q7TSK3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pcdh8Q7TSK3 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pcdh8Q7TSK3 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pcdh8Q7TSK3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pcdh8Q7TSK3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pcdh8Q7TSK3 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pcdh8Q7TSK3 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pcdh8Q7TSK3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pcdh8Q7TSK3 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pcdh8Q7TSK3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pcdh8Q7TSK3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pcdh8Q7TSK3 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pcdh8Q7TSK3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pcdh8Q7TSK3 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pcdh8Q7TSK3 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pcdh8Q7TSK3 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pcdh8Q7TSK3 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pcdh8Q7TSK3 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pcdh8Q7TSK3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pcdh8Q7TSK3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pcdh8Q7TSK3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pcdh8Q7TSK3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pcdh8Q7TSK3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pcdh8Q7TSK3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pcdh8Q7TSK3 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pcdh8Q7TSK3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pcdh8Q7TSK3 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pcdh8Q7TSK3 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pcdh8Q7TSK3 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Pcdh8Q7TSK3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pcdh8Q7TSK3 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pcdh8Q7TSK3 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pcdh8Q7TSK3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pcdh8Q7TSK3 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pcdh8Q7TSK3 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pcdh8Q7TSK3 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pcdh8Q7TSK3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pcdh8Q7TSK3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pcdh8Q7TSK3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pcdh8Q7TSK3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pcdh8Q7TSK3 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pcdh8Q7TSK3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pcdh8Q7TSK3 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Pcdh8Q7TSK3 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pcdh8Q7TSK3 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pcdh8Q7TSK3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pcdh8Q7TSK3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pcdh8Q7TSK3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pcdh8Q7TSK3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Pcdh8Q7TSK3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pcdh8Q7TSK3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pcdh8Q7TSK3 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pcdh8Q7TSK3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pcdh8Q7TSK3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pcdh8Q7TSK3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pcdh8Q7TSK3 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pcdh8Q7TSK3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pcdh8Q7TSK3 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pcdh8Q7TSK3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pcdh8Q7TSK3 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pcdh8Q7TSK3 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pcdh8Q7TSK3 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pcdh8Q7TSK3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pcdh8Q7TSK3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pcdh8Q7TSK3 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pcdh8Q7TSK3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pcdh8Q7TSK3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pcdh8Q7TSK3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pcdh8Q7TSK3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pcdh8Q7TSK3 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pcdh8Q7TSK3 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pcdh8Q7TSK3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pcdh8Q7TSK3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pcdh8Q7TSK3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pcdh8Q7TSK3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pcdh8Q7TSK3 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Pcdh8Q7TSK3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pcdh8Q7TSK3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pcdh8Q7TSK3 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pcdh8Q7TSK3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pcdh8Q7TSK3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pcdh8Q7TSK3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pcdh8Q7TSK3 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pcdh8Q7TSK3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pcdh8Q7TSK3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pcdh8Q7TSK3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pcdh8Q7TSK3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pcdh8Q7TSK3 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Pcdh8Q7TSK3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pcdh8Q7TSK3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pcdh8Q7TSK3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pcdh8Q7TSK3 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pcdh8Q7TSK3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pcdh8Q7TSK3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pcdh8Q7TSK3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pcdh8Q7TSK3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pcdh8Q7TSK3 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pcdh8Q7TSK3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms