Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSI3

Ppp6r1, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp6r1Q7TSI3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ppp6r1Q7TSI3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ppp6r1Q7TSI3 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Ppp6r1Q7TSI3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ppp6r1Q7TSI3 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ppp6r1Q7TSI3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Ppp6r1Q7TSI3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ppp6r1Q7TSI3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ppp6r1Q7TSI3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ppp6r1Q7TSI3 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ppp6r1Q7TSI3 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Ppp6r1Q7TSI3 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ppp6r1Q7TSI3 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ppp6r1Q7TSI3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ppp6r1Q7TSI3 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Ppp6r1Q7TSI3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ppp6r1Q7TSI3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ppp6r1Q7TSI3 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ppp6r1Q7TSI3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ppp6r1Q7TSI3 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Ppp6r1Q7TSI3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ppp6r1Q7TSI3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ppp6r1Q7TSI3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ppp6r1Q7TSI3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ppp6r1Q7TSI3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ppp6r1Q7TSI3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ppp6r1Q7TSI3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ppp6r1Q7TSI3 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Ppp6r1Q7TSI3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ppp6r1Q7TSI3 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ppp6r1Q7TSI3 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ppp6r1Q7TSI3 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ppp6r1Q7TSI3 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ppp6r1Q7TSI3 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ppp6r1Q7TSI3 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ppp6r1Q7TSI3 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ppp6r1Q7TSI3 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ppp6r1Q7TSI3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ppp6r1Q7TSI3 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ppp6r1Q7TSI3 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ppp6r1Q7TSI3 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ppp6r1Q7TSI3 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ppp6r1Q7TSI3 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Ppp6r1Q7TSI3 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ppp6r1Q7TSI3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ppp6r1Q7TSI3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ppp6r1Q7TSI3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ppp6r1Q7TSI3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ppp6r1Q7TSI3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ppp6r1Q7TSI3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ppp6r1Q7TSI3 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ppp6r1Q7TSI3 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Ppp6r1Q7TSI3 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ppp6r1Q7TSI3 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ppp6r1Q7TSI3 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ppp6r1Q7TSI3 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ppp6r1Q7TSI3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ppp6r1Q7TSI3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ppp6r1Q7TSI3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ppp6r1Q7TSI3 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ppp6r1Q7TSI3 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ppp6r1Q7TSI3 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ppp6r1Q7TSI3 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ppp6r1Q7TSI3 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ppp6r1Q7TSI3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ppp6r1Q7TSI3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ppp6r1Q7TSI3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ppp6r1Q7TSI3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ppp6r1Q7TSI3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ppp6r1Q7TSI3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ppp6r1Q7TSI3 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ppp6r1Q7TSI3 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ppp6r1Q7TSI3 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ppp6r1Q7TSI3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ppp6r1Q7TSI3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ppp6r1Q7TSI3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ppp6r1Q7TSI3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ppp6r1Q7TSI3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ppp6r1Q7TSI3 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ppp6r1Q7TSI3 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ppp6r1Q7TSI3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ppp6r1Q7TSI3 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ppp6r1Q7TSI3 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ppp6r1Q7TSI3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ppp6r1Q7TSI3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ppp6r1Q7TSI3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ppp6r1Q7TSI3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ppp6r1Q7TSI3 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Ppp6r1Q7TSI3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ppp6r1Q7TSI3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ppp6r1Q7TSI3 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Ppp6r1Q7TSI3 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ppp6r1Q7TSI3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Ppp6r1Q7TSI3 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ppp6r1Q7TSI3 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ppp6r1Q7TSI3 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ppp6r1Q7TSI3 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ppp6r1Q7TSI3 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ppp6r1Q7TSI3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ppp6r1Q7TSI3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms