Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Actn1Q7TPR4 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Actn1Q7TPR4 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Actn1Q7TPR4 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Actn1Q7TPR4 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Actn1Q7TPR4 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Actn1Q7TPR4 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Actn1Q7TPR4 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Actn1Q7TPR4 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Actn1Q7TPR4 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Actn1Q7TPR4 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Actn1Q7TPR4 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Actn1Q7TPR4 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Actn1Q7TPR4 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Actn1Q7TPR4 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Actn1Q7TPR4 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Actn1Q7TPR4 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Actn1Q7TPR4 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Actn1Q7TPR4 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Actn1Q7TPR4 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Actn1Q7TPR4 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Actn1Q7TPR4 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Actn1Q7TPR4 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Actn1Q7TPR4 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Actn1Q7TPR4 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Actn1Q7TPR4 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Actn1Q7TPR4 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Actn1Q7TPR4 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Actn1Q7TPR4 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Actn1Q7TPR4 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Actn1Q7TPR4 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Actn1Q7TPR4 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Actn1Q7TPR4 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Actn1Q7TPR4 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Actn1Q7TPR4 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Actn1Q7TPR4 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Actn1Q7TPR4 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Actn1Q7TPR4 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Actn1Q7TPR4 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Actn1Q7TPR4 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Actn1Q7TPR4 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Actn1Q7TPR4 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Actn1Q7TPR4 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Actn1Q7TPR4 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Actn1Q7TPR4 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Actn1Q7TPR4 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Actn1Q7TPR4 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Actn1Q7TPR4 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Actn1Q7TPR4 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Actn1Q7TPR4 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Actn1Q7TPR4 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Actn1Q7TPR4 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Actn1Q7TPR4 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Actn1Q7TPR4 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Actn1Q7TPR4 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Actn1Q7TPR4 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Actn1Q7TPR4 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Actn1Q7TPR4 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Actn1Q7TPR4 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Actn1Q7TPR4 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Actn1Q7TPR4 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Actn1Q7TPR4 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
Actn1Q7TPR4 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Actn1Q7TPR4 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Actn1Q7TPR4 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Actn1Q7TPR4 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Actn1Q7TPR4 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Actn1Q7TPR4 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Actn1Q7TPR4 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Actn1Q7TPR4 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Actn1Q7TPR4 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Actn1Q7TPR4 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Actn1Q7TPR4 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Actn1Q7TPR4 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Actn1Q7TPR4 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Actn1Q7TPR4 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Actn1Q7TPR4 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Actn1Q7TPR4 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Actn1Q7TPR4 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Actn1Q7TPR4 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Actn1Q7TPR4 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Actn1Q7TPR4 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Actn1Q7TPR4 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Actn1Q7TPR4 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Actn1Q7TPR4 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Actn1Q7TPR4 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Actn1Q7TPR4 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Actn1Q7TPR4 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Actn1Q7TPR4 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Actn1Q7TPR4 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Actn1Q7TPR4 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Actn1Q7TPR4 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Actn1Q7TPR4 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Actn1Q7TPR4 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Actn1Q7TPR4 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Actn1Q7TPR4 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Actn1Q7TPR4 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Actn1Q7TPR4 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Actn1Q7TPR4 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Actn1Q7TPR4 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms