Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Shq1Q7TMX5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Shq1Q7TMX5 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Shq1Q7TMX5 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Shq1Q7TMX5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Shq1Q7TMX5 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Shq1Q7TMX5 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Shq1Q7TMX5 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Shq1Q7TMX5 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Shq1Q7TMX5 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Shq1Q7TMX5 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Shq1Q7TMX5 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Shq1Q7TMX5 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Shq1Q7TMX5 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Shq1Q7TMX5 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Shq1Q7TMX5 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Shq1Q7TMX5 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Shq1Q7TMX5 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Shq1Q7TMX5 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Shq1Q7TMX5 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Shq1Q7TMX5 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Shq1Q7TMX5 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Shq1Q7TMX5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Shq1Q7TMX5 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Shq1Q7TMX5 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Shq1Q7TMX5 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Shq1Q7TMX5 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Shq1Q7TMX5 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Shq1Q7TMX5 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Shq1Q7TMX5 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Shq1Q7TMX5 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Shq1Q7TMX5 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Shq1Q7TMX5 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Shq1Q7TMX5 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Shq1Q7TMX5 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Shq1Q7TMX5 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Shq1Q7TMX5 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Shq1Q7TMX5 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Shq1Q7TMX5 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Shq1Q7TMX5 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Shq1Q7TMX5 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Shq1Q7TMX5 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Shq1Q7TMX5 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Shq1Q7TMX5 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Shq1Q7TMX5 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Shq1Q7TMX5 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Shq1Q7TMX5 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Shq1Q7TMX5 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Shq1Q7TMX5 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Shq1Q7TMX5 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Shq1Q7TMX5 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Shq1Q7TMX5 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Shq1Q7TMX5 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Shq1Q7TMX5 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Shq1Q7TMX5 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Shq1Q7TMX5 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Shq1Q7TMX5 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Shq1Q7TMX5 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Shq1Q7TMX5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Shq1Q7TMX5 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Shq1Q7TMX5 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Shq1Q7TMX5 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Shq1Q7TMX5 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Shq1Q7TMX5 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Shq1Q7TMX5 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Shq1Q7TMX5 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Shq1Q7TMX5 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Shq1Q7TMX5 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Shq1Q7TMX5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Shq1Q7TMX5 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Shq1Q7TMX5 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Shq1Q7TMX5 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Shq1Q7TMX5 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Shq1Q7TMX5 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Shq1Q7TMX5 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Shq1Q7TMX5 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Shq1Q7TMX5 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Shq1Q7TMX5 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Shq1Q7TMX5 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Shq1Q7TMX5 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Shq1Q7TMX5 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Shq1Q7TMX5 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Shq1Q7TMX5 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Shq1Q7TMX5 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Shq1Q7TMX5 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Shq1Q7TMX5 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Shq1Q7TMX5 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Shq1Q7TMX5 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Shq1Q7TMX5 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Shq1Q7TMX5 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Shq1Q7TMX5 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Shq1Q7TMX5 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Shq1Q7TMX5 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Shq1Q7TMX5 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Shq1Q7TMX5 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Shq1Q7TMX5 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Shq1Q7TMX5 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Shq1Q7TMX5 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Shq1Q7TMX5 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Shq1Q7TMX5 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms