Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMB3

Ppp1r3c, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3C, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r3cQ7TMB3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppp1r3cQ7TMB3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Ppp1r3cQ7TMB3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppp1r3cQ7TMB3 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppp1r3cQ7TMB3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppp1r3cQ7TMB3 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppp1r3cQ7TMB3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppp1r3cQ7TMB3 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppp1r3cQ7TMB3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppp1r3cQ7TMB3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppp1r3cQ7TMB3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppp1r3cQ7TMB3 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppp1r3cQ7TMB3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppp1r3cQ7TMB3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppp1r3cQ7TMB3 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppp1r3cQ7TMB3 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppp1r3cQ7TMB3 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppp1r3cQ7TMB3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppp1r3cQ7TMB3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppp1r3cQ7TMB3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppp1r3cQ7TMB3 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppp1r3cQ7TMB3 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppp1r3cQ7TMB3 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppp1r3cQ7TMB3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppp1r3cQ7TMB3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppp1r3cQ7TMB3 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppp1r3cQ7TMB3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppp1r3cQ7TMB3 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppp1r3cQ7TMB3 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppp1r3cQ7TMB3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppp1r3cQ7TMB3 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppp1r3cQ7TMB3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppp1r3cQ7TMB3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppp1r3cQ7TMB3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppp1r3cQ7TMB3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppp1r3cQ7TMB3 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppp1r3cQ7TMB3 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppp1r3cQ7TMB3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppp1r3cQ7TMB3 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppp1r3cQ7TMB3 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppp1r3cQ7TMB3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppp1r3cQ7TMB3 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppp1r3cQ7TMB3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppp1r3cQ7TMB3 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppp1r3cQ7TMB3 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppp1r3cQ7TMB3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppp1r3cQ7TMB3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppp1r3cQ7TMB3 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppp1r3cQ7TMB3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppp1r3cQ7TMB3 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppp1r3cQ7TMB3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppp1r3cQ7TMB3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppp1r3cQ7TMB3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppp1r3cQ7TMB3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppp1r3cQ7TMB3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppp1r3cQ7TMB3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppp1r3cQ7TMB3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppp1r3cQ7TMB3 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppp1r3cQ7TMB3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppp1r3cQ7TMB3 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppp1r3cQ7TMB3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppp1r3cQ7TMB3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppp1r3cQ7TMB3 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppp1r3cQ7TMB3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppp1r3cQ7TMB3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppp1r3cQ7TMB3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppp1r3cQ7TMB3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppp1r3cQ7TMB3 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppp1r3cQ7TMB3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppp1r3cQ7TMB3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppp1r3cQ7TMB3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppp1r3cQ7TMB3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppp1r3cQ7TMB3 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppp1r3cQ7TMB3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppp1r3cQ7TMB3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppp1r3cQ7TMB3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppp1r3cQ7TMB3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppp1r3cQ7TMB3 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppp1r3cQ7TMB3 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppp1r3cQ7TMB3 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppp1r3cQ7TMB3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppp1r3cQ7TMB3 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppp1r3cQ7TMB3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppp1r3cQ7TMB3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppp1r3cQ7TMB3 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppp1r3cQ7TMB3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppp1r3cQ7TMB3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppp1r3cQ7TMB3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppp1r3cQ7TMB3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppp1r3cQ7TMB3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppp1r3cQ7TMB3 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppp1r3cQ7TMB3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppp1r3cQ7TMB3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppp1r3cQ7TMB3 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppp1r3cQ7TMB3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppp1r3cQ7TMB3 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppp1r3cQ7TMB3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppp1r3cQ7TMB3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppp1r3cQ7TMB3 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppp1r3cQ7TMB3 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms