Protein–RNA interactions for Protein: Q715T0

Nme8, Thioredoxin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme8Q715T0 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nme8Q715T0 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nme8Q715T0 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nme8Q715T0 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nme8Q715T0 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nme8Q715T0 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nme8Q715T0 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nme8Q715T0 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Nme8Q715T0 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nme8Q715T0 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nme8Q715T0 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nme8Q715T0 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nme8Q715T0 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nme8Q715T0 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nme8Q715T0 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nme8Q715T0 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nme8Q715T0 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nme8Q715T0 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nme8Q715T0 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nme8Q715T0 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nme8Q715T0 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nme8Q715T0 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nme8Q715T0 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nme8Q715T0 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nme8Q715T0 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nme8Q715T0 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nme8Q715T0 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nme8Q715T0 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nme8Q715T0 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nme8Q715T0 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nme8Q715T0 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nme8Q715T0 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nme8Q715T0 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nme8Q715T0 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nme8Q715T0 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nme8Q715T0 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nme8Q715T0 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nme8Q715T0 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nme8Q715T0 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nme8Q715T0 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nme8Q715T0 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nme8Q715T0 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nme8Q715T0 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nme8Q715T0 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nme8Q715T0 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nme8Q715T0 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nme8Q715T0 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nme8Q715T0 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nme8Q715T0 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nme8Q715T0 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nme8Q715T0 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nme8Q715T0 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nme8Q715T0 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nme8Q715T0 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Nme8Q715T0 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nme8Q715T0 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Nme8Q715T0 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nme8Q715T0 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nme8Q715T0 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nme8Q715T0 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nme8Q715T0 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nme8Q715T0 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nme8Q715T0 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nme8Q715T0 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nme8Q715T0 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nme8Q715T0 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nme8Q715T0 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nme8Q715T0 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nme8Q715T0 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Nme8Q715T0 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nme8Q715T0 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nme8Q715T0 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Nme8Q715T0 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nme8Q715T0 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nme8Q715T0 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nme8Q715T0 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nme8Q715T0 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nme8Q715T0 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Nme8Q715T0 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nme8Q715T0 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nme8Q715T0 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nme8Q715T0 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nme8Q715T0 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nme8Q715T0 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nme8Q715T0 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nme8Q715T0 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nme8Q715T0 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nme8Q715T0 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nme8Q715T0 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nme8Q715T0 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nme8Q715T0 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Nme8Q715T0 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nme8Q715T0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nme8Q715T0 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nme8Q715T0 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nme8Q715T0 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nme8Q715T0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Nme8Q715T0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nme8Q715T0 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nme8Q715T0 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms