Protein–RNA interactions for Protein: Q704Y3

Trpv1, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 1, mousemouse

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv1Q704Y3 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trpv1Q704Y3 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trpv1Q704Y3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Trpv1Q704Y3 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trpv1Q704Y3 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trpv1Q704Y3 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trpv1Q704Y3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trpv1Q704Y3 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trpv1Q704Y3 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trpv1Q704Y3 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Trpv1Q704Y3 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trpv1Q704Y3 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trpv1Q704Y3 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trpv1Q704Y3 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trpv1Q704Y3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trpv1Q704Y3 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trpv1Q704Y3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trpv1Q704Y3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trpv1Q704Y3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trpv1Q704Y3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trpv1Q704Y3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trpv1Q704Y3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trpv1Q704Y3 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trpv1Q704Y3 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trpv1Q704Y3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trpv1Q704Y3 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trpv1Q704Y3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trpv1Q704Y3 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trpv1Q704Y3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trpv1Q704Y3 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Trpv1Q704Y3 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trpv1Q704Y3 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trpv1Q704Y3 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trpv1Q704Y3 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trpv1Q704Y3 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trpv1Q704Y3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trpv1Q704Y3 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trpv1Q704Y3 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trpv1Q704Y3 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Trpv1Q704Y3 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trpv1Q704Y3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trpv1Q704Y3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trpv1Q704Y3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trpv1Q704Y3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trpv1Q704Y3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trpv1Q704Y3 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trpv1Q704Y3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trpv1Q704Y3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trpv1Q704Y3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trpv1Q704Y3 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trpv1Q704Y3 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trpv1Q704Y3 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trpv1Q704Y3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trpv1Q704Y3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trpv1Q704Y3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trpv1Q704Y3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trpv1Q704Y3 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trpv1Q704Y3 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trpv1Q704Y3 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trpv1Q704Y3 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trpv1Q704Y3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trpv1Q704Y3 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trpv1Q704Y3 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trpv1Q704Y3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Trpv1Q704Y3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trpv1Q704Y3 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trpv1Q704Y3 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trpv1Q704Y3 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trpv1Q704Y3 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trpv1Q704Y3 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trpv1Q704Y3 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trpv1Q704Y3 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trpv1Q704Y3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trpv1Q704Y3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trpv1Q704Y3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trpv1Q704Y3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trpv1Q704Y3 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Trpv1Q704Y3 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trpv1Q704Y3 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Trpv1Q704Y3 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trpv1Q704Y3 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Trpv1Q704Y3 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trpv1Q704Y3 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trpv1Q704Y3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trpv1Q704Y3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trpv1Q704Y3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trpv1Q704Y3 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trpv1Q704Y3 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trpv1Q704Y3 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trpv1Q704Y3 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trpv1Q704Y3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trpv1Q704Y3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trpv1Q704Y3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trpv1Q704Y3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trpv1Q704Y3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trpv1Q704Y3 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trpv1Q704Y3 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trpv1Q704Y3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trpv1Q704Y3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trpv1Q704Y3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms