Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ93

Usp34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, mousemouse

Predictions only

Length 3,582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp34Q6ZQ93 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp34Q6ZQ93 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp34Q6ZQ93 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp34Q6ZQ93 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp34Q6ZQ93 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp34Q6ZQ93 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp34Q6ZQ93 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp34Q6ZQ93 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp34Q6ZQ93 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp34Q6ZQ93 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp34Q6ZQ93 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp34Q6ZQ93 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp34Q6ZQ93 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp34Q6ZQ93 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp34Q6ZQ93 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp34Q6ZQ93 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp34Q6ZQ93 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp34Q6ZQ93 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp34Q6ZQ93 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp34Q6ZQ93 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp34Q6ZQ93 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp34Q6ZQ93 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp34Q6ZQ93 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp34Q6ZQ93 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp34Q6ZQ93 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp34Q6ZQ93 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp34Q6ZQ93 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp34Q6ZQ93 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp34Q6ZQ93 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp34Q6ZQ93 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp34Q6ZQ93 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp34Q6ZQ93 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp34Q6ZQ93 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp34Q6ZQ93 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp34Q6ZQ93 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp34Q6ZQ93 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp34Q6ZQ93 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp34Q6ZQ93 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp34Q6ZQ93 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp34Q6ZQ93 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp34Q6ZQ93 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp34Q6ZQ93 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp34Q6ZQ93 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp34Q6ZQ93 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp34Q6ZQ93 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp34Q6ZQ93 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp34Q6ZQ93 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp34Q6ZQ93 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp34Q6ZQ93 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp34Q6ZQ93 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp34Q6ZQ93 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp34Q6ZQ93 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp34Q6ZQ93 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp34Q6ZQ93 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp34Q6ZQ93 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp34Q6ZQ93 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp34Q6ZQ93 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp34Q6ZQ93 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp34Q6ZQ93 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp34Q6ZQ93 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp34Q6ZQ93 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp34Q6ZQ93 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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Usp34Q6ZQ93 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp34Q6ZQ93 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp34Q6ZQ93 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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Usp34Q6ZQ93 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp34Q6ZQ93 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp34Q6ZQ93 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp34Q6ZQ93 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp34Q6ZQ93 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp34Q6ZQ93 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp34Q6ZQ93 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp34Q6ZQ93 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp34Q6ZQ93 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp34Q6ZQ93 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp34Q6ZQ93 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp34Q6ZQ93 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp34Q6ZQ93 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp34Q6ZQ93 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp34Q6ZQ93 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp34Q6ZQ93 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp34Q6ZQ93 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp34Q6ZQ93 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp34Q6ZQ93 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp34Q6ZQ93 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp34Q6ZQ93 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp34Q6ZQ93 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp34Q6ZQ93 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp34Q6ZQ93 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp34Q6ZQ93 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp34Q6ZQ93 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp34Q6ZQ93 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp34Q6ZQ93 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp34Q6ZQ93 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp34Q6ZQ93 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp34Q6ZQ93 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp34Q6ZQ93 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
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