Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPY7

Kdm3b, Lysine-specific demethylase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm3bQ6ZPY7 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Kdm3bQ6ZPY7 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Kdm3bQ6ZPY7 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Kdm3bQ6ZPY7 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Kdm3bQ6ZPY7 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Kdm3bQ6ZPY7 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Kdm3bQ6ZPY7 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Kdm3bQ6ZPY7 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Kdm3bQ6ZPY7 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Kdm3bQ6ZPY7 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Kdm3bQ6ZPY7 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Kdm3bQ6ZPY7 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Kdm3bQ6ZPY7 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Kdm3bQ6ZPY7 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Kdm3bQ6ZPY7 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Kdm3bQ6ZPY7 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Kdm3bQ6ZPY7 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Kdm3bQ6ZPY7 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Kdm3bQ6ZPY7 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Kdm3bQ6ZPY7 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Kdm3bQ6ZPY7 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Kdm3bQ6ZPY7 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Kdm3bQ6ZPY7 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Kdm3bQ6ZPY7 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Kdm3bQ6ZPY7 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Kdm3bQ6ZPY7 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Kdm3bQ6ZPY7 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Kdm3bQ6ZPY7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Kdm3bQ6ZPY7 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Kdm3bQ6ZPY7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Kdm3bQ6ZPY7 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Kdm3bQ6ZPY7 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Kdm3bQ6ZPY7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Kdm3bQ6ZPY7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Kdm3bQ6ZPY7 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Kdm3bQ6ZPY7 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Kdm3bQ6ZPY7 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Kdm3bQ6ZPY7 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Kdm3bQ6ZPY7 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Kdm3bQ6ZPY7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Kdm3bQ6ZPY7 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Kdm3bQ6ZPY7 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Kdm3bQ6ZPY7 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Kdm3bQ6ZPY7 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Kdm3bQ6ZPY7 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Kdm3bQ6ZPY7 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Kdm3bQ6ZPY7 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Kdm3bQ6ZPY7 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Kdm3bQ6ZPY7 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.55■■■□□ 2
Kdm3bQ6ZPY7 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Kdm3bQ6ZPY7 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Kdm3bQ6ZPY7 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Kdm3bQ6ZPY7 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Kdm3bQ6ZPY7 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Kdm3bQ6ZPY7 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Kdm3bQ6ZPY7 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Kdm3bQ6ZPY7 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Kdm3bQ6ZPY7 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Kdm3bQ6ZPY7 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Kdm3bQ6ZPY7 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Kdm3bQ6ZPY7 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Kdm3bQ6ZPY7 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Kdm3bQ6ZPY7 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Kdm3bQ6ZPY7 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Kdm3bQ6ZPY7 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Kdm3bQ6ZPY7 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Kdm3bQ6ZPY7 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Kdm3bQ6ZPY7 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Kdm3bQ6ZPY7 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Kdm3bQ6ZPY7 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Kdm3bQ6ZPY7 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Kdm3bQ6ZPY7 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Kdm3bQ6ZPY7 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Kdm3bQ6ZPY7 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Kdm3bQ6ZPY7 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Kdm3bQ6ZPY7 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Kdm3bQ6ZPY7 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Kdm3bQ6ZPY7 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Kdm3bQ6ZPY7 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Kdm3bQ6ZPY7 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Kdm3bQ6ZPY7 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Kdm3bQ6ZPY7 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Kdm3bQ6ZPY7 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Kdm3bQ6ZPY7 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Kdm3bQ6ZPY7 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Kdm3bQ6ZPY7 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Kdm3bQ6ZPY7 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Kdm3bQ6ZPY7 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Kdm3bQ6ZPY7 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Kdm3bQ6ZPY7 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Kdm3bQ6ZPY7 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Kdm3bQ6ZPY7 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Kdm3bQ6ZPY7 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Kdm3bQ6ZPY7 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Kdm3bQ6ZPY7 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Kdm3bQ6ZPY7 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Kdm3bQ6ZPY7 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Kdm3bQ6ZPY7 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Kdm3bQ6ZPY7 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Kdm3bQ6ZPY7 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms