Protein–RNA interactions for Protein: Q6W9L1

H2-M2, Histocompatibility 2, M region locus 2, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M2Q6W9L1 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-M2Q6W9L1 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-M2Q6W9L1 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-M2Q6W9L1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-M2Q6W9L1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-M2Q6W9L1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-M2Q6W9L1 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-M2Q6W9L1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-M2Q6W9L1 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-M2Q6W9L1 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-M2Q6W9L1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-M2Q6W9L1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-M2Q6W9L1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-M2Q6W9L1 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-M2Q6W9L1 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-M2Q6W9L1 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-M2Q6W9L1 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-M2Q6W9L1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-M2Q6W9L1 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-M2Q6W9L1 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-M2Q6W9L1 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-M2Q6W9L1 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-M2Q6W9L1 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-M2Q6W9L1 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-M2Q6W9L1 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-M2Q6W9L1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-M2Q6W9L1 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-M2Q6W9L1 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-M2Q6W9L1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-M2Q6W9L1 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-M2Q6W9L1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-M2Q6W9L1 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-M2Q6W9L1 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-M2Q6W9L1 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-M2Q6W9L1 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-M2Q6W9L1 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-M2Q6W9L1 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-M2Q6W9L1 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-M2Q6W9L1 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-M2Q6W9L1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-M2Q6W9L1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-M2Q6W9L1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-M2Q6W9L1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-M2Q6W9L1 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-M2Q6W9L1 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-M2Q6W9L1 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-M2Q6W9L1 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
H2-M2Q6W9L1 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
H2-M2Q6W9L1 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
H2-M2Q6W9L1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-M2Q6W9L1 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-M2Q6W9L1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-M2Q6W9L1 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-M2Q6W9L1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-M2Q6W9L1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-M2Q6W9L1 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-M2Q6W9L1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-M2Q6W9L1 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-M2Q6W9L1 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-M2Q6W9L1 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-M2Q6W9L1 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-M2Q6W9L1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-M2Q6W9L1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-M2Q6W9L1 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-M2Q6W9L1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-M2Q6W9L1 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-M2Q6W9L1 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-M2Q6W9L1 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-M2Q6W9L1 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-M2Q6W9L1 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-M2Q6W9L1 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-M2Q6W9L1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-M2Q6W9L1 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-M2Q6W9L1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-M2Q6W9L1 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-M2Q6W9L1 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-M2Q6W9L1 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-M2Q6W9L1 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-M2Q6W9L1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-M2Q6W9L1 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-M2Q6W9L1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-M2Q6W9L1 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-M2Q6W9L1 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-M2Q6W9L1 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-M2Q6W9L1 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-M2Q6W9L1 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-M2Q6W9L1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-M2Q6W9L1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-M2Q6W9L1 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-M2Q6W9L1 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-M2Q6W9L1 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-M2Q6W9L1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-M2Q6W9L1 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-M2Q6W9L1 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-M2Q6W9L1 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-M2Q6W9L1 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-M2Q6W9L1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-M2Q6W9L1 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-M2Q6W9L1 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-M2Q6W9L1 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms