Protein–RNA interactions for Protein: Q6QNU9

Tlr12, Toll-like receptor 12, mousemouse

Predictions only

Length 906 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr12Q6QNU9 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlr12Q6QNU9 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlr12Q6QNU9 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlr12Q6QNU9 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlr12Q6QNU9 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlr12Q6QNU9 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlr12Q6QNU9 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlr12Q6QNU9 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlr12Q6QNU9 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlr12Q6QNU9 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlr12Q6QNU9 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlr12Q6QNU9 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlr12Q6QNU9 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlr12Q6QNU9 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tlr12Q6QNU9 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tlr12Q6QNU9 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tlr12Q6QNU9 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tlr12Q6QNU9 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tlr12Q6QNU9 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tlr12Q6QNU9 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tlr12Q6QNU9 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tlr12Q6QNU9 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tlr12Q6QNU9 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tlr12Q6QNU9 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tlr12Q6QNU9 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tlr12Q6QNU9 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Tlr12Q6QNU9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tlr12Q6QNU9 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tlr12Q6QNU9 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tlr12Q6QNU9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Tlr12Q6QNU9 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tlr12Q6QNU9 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tlr12Q6QNU9 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tlr12Q6QNU9 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tlr12Q6QNU9 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Tlr12Q6QNU9 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tlr12Q6QNU9 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tlr12Q6QNU9 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tlr12Q6QNU9 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tlr12Q6QNU9 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tlr12Q6QNU9 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tlr12Q6QNU9 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tlr12Q6QNU9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tlr12Q6QNU9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Tlr12Q6QNU9 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tlr12Q6QNU9 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tlr12Q6QNU9 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tlr12Q6QNU9 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Tlr12Q6QNU9 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tlr12Q6QNU9 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tlr12Q6QNU9 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Tlr12Q6QNU9 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tlr12Q6QNU9 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tlr12Q6QNU9 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tlr12Q6QNU9 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tlr12Q6QNU9 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Tlr12Q6QNU9 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tlr12Q6QNU9 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tlr12Q6QNU9 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tlr12Q6QNU9 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tlr12Q6QNU9 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tlr12Q6QNU9 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tlr12Q6QNU9 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tlr12Q6QNU9 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tlr12Q6QNU9 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tlr12Q6QNU9 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tlr12Q6QNU9 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tlr12Q6QNU9 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tlr12Q6QNU9 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tlr12Q6QNU9 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tlr12Q6QNU9 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tlr12Q6QNU9 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Tlr12Q6QNU9 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tlr12Q6QNU9 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tlr12Q6QNU9 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tlr12Q6QNU9 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tlr12Q6QNU9 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Tlr12Q6QNU9 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tlr12Q6QNU9 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tlr12Q6QNU9 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tlr12Q6QNU9 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tlr12Q6QNU9 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tlr12Q6QNU9 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tlr12Q6QNU9 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tlr12Q6QNU9 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tlr12Q6QNU9 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tlr12Q6QNU9 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tlr12Q6QNU9 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tlr12Q6QNU9 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tlr12Q6QNU9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tlr12Q6QNU9 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tlr12Q6QNU9 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tlr12Q6QNU9 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tlr12Q6QNU9 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Tlr12Q6QNU9 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tlr12Q6QNU9 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tlr12Q6QNU9 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tlr12Q6QNU9 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tlr12Q6QNU9 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tlr12Q6QNU9 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms